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本实验选取健康成年的公马(Equus caballus)、公驴(Equus asinus)、公马骡(Equus mulus)、公驴骡(Equus hinnus)和公骡驹(foal),采集耳部皮肤组织,建立成纤维细胞系,并进行核型分析,以确认品种的正确性。染色体核型结果是公马为2n=64(XY),公驴为2n=62(XY),公马骡为2n=63(XY),公驴骡为2n=63(XY),公骡驹为2n=62(XY)。这5种动物的核型与前人研究的结果一致。本研究参考人、鼠、牛Y连锁保守框3 (DEAD box 3, Y-linked,DDX3Y)基因序列,用比较基因组和克隆测序的方法,得到公马(Equus caballus)、公驴(Equus asinus)、公马骡(Equus mulus)、公驴骡(Equus hinnus)和公骡驹(foal)的DDX3Y基因部分序列,并用生物信息学方法分析这5种基因片段相互间的差异。结果表明,公马、公驴、公马骡、公驴骡和公骡驹DDX3Y基因片段包含从第5外显子后半部分到第17外显子的前半部分,大小分别为4917bp、4912bp、4917bp、4917bp、4918bp,序列相似性是99.0%,这5个基因片段之间存在55个碱基的差异。上述5种动物的DDX3Y基因编码均为521个氨基酸,编码区有5个碱基的差异,氨基酸有两处差异,包含类DEAD解旋酶超家族(DEAD-like helicases superfamily, DEXDc)和解旋酶超家族c端结构域(helicase superfamily c-terminal domain, HELICc)。此外,实验结果也显示了公马与公马骡和公骡驹、公驴与公驴骡的DDX3Y基因进化相对更近的亲缘关系。本实验首次检测比较了马属雄性动物及其杂交后代的DDX3Y基因序列以及氨基酸编码和基因进化特征,为进一步研究DDX3Y基因功能与公骡不育调控机制提供了基础科学依据。