中国自改革开放以来,经济高速增长,取得了巨大的成就,但同时制造业陷入全球价值链低端环节的窘境迫使中国进入了一个亟待创新驱动的转型阶段。从创新投入来看,中国大中型工业企业的研发强度从2005年的0.76%到2010年的1.71%,而制造业大国美国、德国和日本的研发强度分别达到2.89%、2.64%和3.42%；从创新的产出来看,新产品销售收入占主营业务收入比重不断提升,1991年为9.9%,2007年增至15.7%,而美、日、德等发达国家平均水平往往在50%以上。可以看出,中国的创新水平距发达国家的平均水平还有很大差距。从企业创新的决定因素来说,所有权结构是影响企业创新决策和创新绩效的重要因素。在发达经济体中所有权集中度分散,公司治理中委托代理冲突是企业创新的重要障碍；而新兴经济体中集中型所有权结构占据主导地位,这种制度情境使代理关系发生了重要变化。在外部治理机制缺失的制度环境中,股东和职业经理人的矛盾冲突转变为控股股东和小股东之间的冲突,即所有者冲突。代理关系在不同经济体之间发生了变化,使得所有权结构对创新的关系变得更加复杂。为了更好地解决中国企业创新存在的问题,必须从中国转型经济的实际出发,探索所有权结构影响企业创新的内在动因和作用机理,才能从根本上发展创新型企业。因此,对所有权结构与企业创新之间的关系进入深入研究就具有重要的现实意义。现有研究探索所有权结构对创新的影响主要涉及以下三个方面：(1)研究争论的焦点在于所有权结构是否与企业创新存在联系；(2)集中型所有权能否更有效地监督管理者,开展创新活动,进而提高创新绩效；(3)基于企业投资者类型的视角,强调不同所有权类型对创新具有怎样的异质性影响。然而,现有研究主题分散、缺乏相互联系和有机整合,而且西方学者大多数从发达国家的立场来对企业创新进行研究,作为转型经济体的中国具有独特的情境特征,所有权结构与创新关系的结论与发达国家未必一致。在此基础上,本文利用代理理论视角探讨所有权结构对企业创新的影响。站在中国情境的立场上,我们不禁要问：委托代理理论是否能解释中国情境下所有权结构与创新的关系?面对现有相互矛盾的实证结果,所有权结构与创新关系的一般性结论是什么?在中国现阶段转型经济条件下,所有权结构会对企业创新产生怎样的影响?国有企业作为国民经济的支柱,其所有权结构会对企业创新产生怎样的影响?针对以上研究问题,本文从以下三个方面展开研究,主要工作及结论具体如下：第一,传统的委托代理理论并不能解释中国情境下所有权结构与企业创新的关系,如果仍然利用传统的委托代理冲突来理解所有权结构与创新的关系,必然会产生偏差。所以,为了解决这一问题,本文第三章将构建代理理论的情境化模型,提出委托代理冲突与所有者冲突在组织内部是共存的重要结论,从而为解释所有权结构与创新的关系寻找全新的理论视角。第二,到目前为止,还缺少一个系统、客观地总结及评价,缺少对现有实证研究所产生的差异及不一致结论进行分析、总结与解释。本文第四章收集整理1988-2014年发表的41篇实证文献,并进行元分析,对这些相互独立的众多研究所产生的混合性研究结果进行定量分析,剖析单项研究间的差异,归纳和总结出更可靠的一般性结论。结果表明,所有权集中度对研发投资具有负向影响,而对创新绩效具有正向影响；不同的所有权类型因其动机和资源不同,对委托代理冲突和所有者冲突产生不同的影响,进而对企业研发投资,创新绩效产生不同的影响。第三,现有研究忽视了转型经济体情境下所有权结构对创新的影响。基于此,本文第五、六章分别利用中国工业企业总样本和国有企业子样本的数据,实证检验所有权结构与企业创新的关系。研究表明,集中型所有权与研发投入、创新产出负向相关；国有企业具有高水平的研发投入,但创新产出不高,外资企业在创新产出方面具有明显优势；与外资企业相比,国有企业与民营企业更加注重财务绩效。国有企业高投入、低效率的创新现状表明,委托代理冲突是国有企业代理问题的主要矛盾。本文的主要目标在于重新审视所有权结构的代理问题对企业研发投资和创新绩效的影响机理,丰富和发展代理理论与企业创新战略理论,为企业创新实践提供政策建议,提升我国企业创新的水平。本文的创新之处在于以下四个方面：第一,在现有代理理论模型的基础上,本文构建了代理理论的情境化模型,提出委托代理冲突与所有者冲突在组织内部是共存的重要结论,进一步发展了代理理论。第二,本文突破了现有研究基于传统委托代理理论视角的局限,提出了整合委托代理冲突与所有者冲突视角来解释所有权结构与研发投资、创新绩效关系的全新理论视角。第三,现有研究关于所有权结构与创新的结论不一致,缺少对这些研究成果所产生的差异进行分析、总结与解释,本文创新性地利用元分析方法对所有权结构与创新关系给出了一般性结论,为进一步开展该领域的研究提供了重要参考依据。第四,现有研究忽视了转型经济体情境下所有权结构对创新的影响,本文结合中国现阶段转型经济条件下不同所有权结构的特点,实证检验了所有权结构与创新的关系,高度契合了以创新驱动视角讨论中国企业内部治理结构的现实需求。