当前农业发展中“小生产”与“大市场”之间的矛盾仍表现突出,农产品供需失衡、价格波动异常和流通损耗严重等问题的根源在于农产品流通业发展水平较低,而农产品流通效率是农产品流通业发展水平的重要表现。因此,提升农产品流通效率有利于降低农产品流通损耗、稳定农产品价格、调节农业生产结构和增加农民收入。现状下,农产品流通组织化程度低、物流基础设施存在较大需求缺口、运营管理水平低和流通资源的结构性失调等问题突出,亟待整治以完善农产品流通体系,优化农产品流通效率。从农产品批零企业(市场)的角度构建投入产出指标体系,采用超效率DEA方法测算全国层面和东、中、西部区域农产品流通效率。东部区域农产品流通处于综合技术效率有效状态,而中、西部区域处于综合技术效率无效状态,但中部区域综合技术效率略高于西部。东、西部区域农产品流通基本处于纯技术效率有效状态,而中部区域则处于无效状态,但其规模效率高于东、西部区域。东、中和西部区域农产品流通都处于规模效率无效状态。采用面板数据回归方法分析各因素对农产品流通效率的影响效应。主要结论有:物流业发展水平对西部农产品流通效率产生显著正向影响;流通组织化程度、农产品流通固定资产投资对中部农产品流通效率产生显著正向影响;农产品批零业规模与东、中、西部农产品流通效率呈显著正向关系;农产品批零企业平均销售额与东、西部农产品流通效率呈显著正向关系;农产品流通固定资产投资与东部农产品流通效率呈显著负向关系;农产品流通从业人数与中、西部农产品流通效率呈显著负向关系。分短期、中期、长期三个阶段提出东、中、西部农产品流通效率的优化策略。短期优化策略重点关注农产品流通体系内部组织和功能的完善,相关策略主要有:从供应链业务整合、增建农产品交易市场等方面扩大东部农产品批零业规模;在中部培养一批大型农产品批零企业并推广应用农产品流通技术;在西部孵化一批强市场影响力的地区性批零企业并注重培养和引进农产品流通专业人才。中期优化策略主要从强化农产品流通业功能、提升流通体系参与主体运营效率着手,相关策略主要有:通过企业并购及其管理变革提升东部农产品批零企业销售额;加大中部农产品流通固定资产投资;西部推进农产品批零企业业务形式创新、拓展业务市场以扩大农产品销售规模。长期优化策略重点从区域、行业层面着手,相关策略主要有:通过鼓励企业资产并购、限制新建优化东部区域农产品流通固定资产投资效率;引导流通组织法人化、构建稳定而多样化的供应链以提升中部农产品流通组织化程度;从完善基础设施建设、搭建核心物流网络和调整物流产业链结构方面提升西部物流业发展水平。