肠炎沙门菌转录因子SEN2967和SEN3610调控基因的筛选与鉴定

来源 :扬州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:karavika
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
肠炎沙门菌(Salmonella enterica serovar Entrritidis,S.Enteritidis,SE)是革兰阴性兼性胞内寄生菌,对人类和动物都具有致病性,是重要的人兽共患病原菌。转录因子(Transcriptionfactor,TF)是一类能够结合在特定基因上游特异核苷酸序列上的蛋白,并能调控该基因的转录。转录因子可调控细菌毒力因子的表达,参与生理生化代谢过程,因此对沙门菌转录因子的研究对于沙门菌致病机制与防控研究都具有重要意义。本实验室前期研究中利用SCOTS技术筛选肠炎沙门菌感染禽源巨噬细胞HD-11的过程中表达的基因,两个候选转录因子SEN2967和SEN3610基因的胞内转录水平显著高于体外培养状态下的表达水平,但国内外对这两个假定转录调控因子的研究未见报道。本研究通过同源重组的方法成功构建了肠炎沙门菌SEN2967和SEN3610基因缺失株及其诱导型表达株;并通过双向电泳、iTraQ技术对二者调控的基因表达进行了分析;对于筛选获得的基因,采用EMSA进行验证。1肠炎沙门菌C50041转录因子SEN2967和SEN3610的缺失株与表达株的构建及其生物学特性鉴定利用荧光定量PCR比较肠炎沙门菌C50041感染HD-11细胞5 h后与体外培养条件下转录水平的表达差异,证实SEN2967上调约98倍,SEN3610上调约15倍。本研究利用λ-red同源重组系统成功构建了肠炎沙门菌缺失株C50041△SEN2967、C50041△SEN3610*pBad24及以 pBad24 为载体的诱导型表达株 C50041△SEN2967(pBad24-SEN29673*Flag)、C50041△SEN3610(pBad24-SEN36103*Flag)。Western Blot 结果显示,诱导型表达株中SEN2967和SEN3610蛋白经诱导后均成功表达。生物学特性结果表明,SEN2967和SEN3610的缺失均不影响肠炎沙门菌的生理生化特性;小鼠体内竞争实验表明,SEN2967和SEN3610缺失株的致病力均明显低于野生株C50041。肠炎沙门菌SEN2967和SEN3610基因缺失株和诱导型表达株的成功构建为后期筛选SEN2967和SEN3610调控的基因表达研究提供了相应的生物材料。2肠炎沙门菌C50041转录因子SEN2967和SEN3610的蛋白质组学研究本研究通过双向电泳分析SEN2967和SEN3610缺失株与表达株的蛋白表达水平差异。分别提取SEN2967和SEN3610的缺失株和表达株的全菌蛋白,在确保上样量一致的前提下,进行双向凝胶电泳,银染后扫描获得2D图谱,经PD Quest软件分析,检测出SEN2967的缺失株和表达株有56个差异蛋白点,检测出SEN3610的缺失株和表达株有91个差异蛋白点。随后我们利用iTraQ技术检测缺失株与表达株中表达差异的蛋白谱,在差异倍数≥1.5或者≤0.67倍,P值≤0.05的条件下,SEN2967缺失株与诱导型表达株相比,上调表达的蛋白有81个,下调表达的蛋白有90个,共计差异数量171;SEN3610缺失株与表达株相比,上调表达的蛋白有25个,下调表达的蛋白有21个,共计差异数量46。这一结果与双向电泳均表明SEN2967和SEN3610基因的缺失或诱导表达可以引起细菌中其它蛋白表达的变化。iTraQ结果进一步显示,在SEN2967和SEN3610缺失株中下调表达的蛋白库中存在与T3SS紧密相关的蛋白,主要包括SPI-1和SPI-5的效应蛋白,以及与针状结构形成相关的蛋白。选择部分与T3SS相关且表达量差异明显的蛋白表达基因,利用荧光定量PCR检测转录水平的表达差异,结果表明转录水平与翻译水平的表达并非平行关系。本研究筛选获得的蛋白为进一步研究SEN2967和SEN3610在肠炎沙门菌转录调控过程中参与的信号通路奠定了基础。3肠炎沙门菌C50041转录因子SEN3610调控基因的EMSA验证为了筛选和鉴定转录因子SEN3610直接调控的基因,我们利用EMSA实验来检测转录因子和调控的基因启动子之间的相互作用。首先利用pMAL-5载体成功构建了 SEN3610原核表达载体,获得重组菌株、E.coli ER2523(pMAL-c5X-SEN3610)和E.coli ER2523(pMAL-p5X-SEN3610);纯化回收MBP-SEN3610融合蛋白约40 mg,并经透析后用于EMSA实验。根据第二章筛选获得的基因序列,分别定位其启动子序列,通过两级PCR合成5’ FAM荧光标记的探针。在EMSA反应体系下验证SEN3610与各探针的结合情况。结果表明,SEN3610与hilA,hilD和pipD的启动子序列有明显的结合现象。这一结果表明SEN3610可能通过参与调控hilA和hilD的表达间接参与调控T3SS效应蛋白的表达。为深入研究T3SS的表达调控奠定了基础。
其他文献
目的:了解2013年8月-2014年7月上海市腹泻病例的病原谱和流行病学特征. 方法:随机抽取23所不同级别医院,对在其肠道门诊就诊的腹泻病例按一定的抽样间隔进行调查,并采集粪
生脉散是金元时代张元素所创的益气养阴方剂,主治热伤元气、阴液亏耗的气阴两虚,临床应用广泛。多年来,国内学者对中药复方生脉散的药理实验、作用机理及临床应用进行了广泛的研
有一句名言是这样的:The future belongs to those who believe in the beauty of their dreams.这样的话总是让人为之振奋,可梦想之路总是充满了太多的荆棘,沉重的现实让我
  随着油田的不断开采,利用水驱直接开采的油田越来越少。在油田开采过程中,由于原油的粘度比较大,胶质沥青质含量高,驱替/被驱替介质流度比差异的增大,使得乳化降粘成为提高采
  克拉玛依油田七中区为稀油油藏,油藏中内源微生物含量较为丰富,具有较好的内源微生物驱油潜力。本文利用实时荧光定量PCR 检测技术,对七中区微生物驱过程中采油功能菌如烃氧
本研究通过建立脂多糖(LPS)刺激小鼠腹腔巨噬细胞RAW264.7的炎症模型,从体外研究冬虫夏草菌丝体——中国被毛孢粗提取物的抗炎作用,并对其抗炎机理做初步探索,为进一步体内研究,
目的:探讨浙江省流行季节涉禽场所外环境的禽流感病毒污染特征和危险因素,为疾病的预防控制提供依据. 方法:采集2014年10月-2015年3月期间5类涉禽场所的外环境标本,每月一
  红003 井区清水河组油藏为典型的砂砾岩超稠油油藏,2009 年投入开发以来,已进行了多轮次的吞吐生产,预计蒸汽吞吐采收率不超过20%,亟需转换开发方式,进一步提高采收率。在
会议
  在七东1 区克下组砾岩油藏30 万吨聚合物驱驱油方案设计基础之上,结合试验区空白水驱阶段油、水井生产动态,建立了“以动校静、动静结合”的单井注聚参数个性化设计原则与
  克拉玛依油田七中区克下组油藏属Ⅱ类砾岩油藏,2007 年在该油藏开辟了二元驱试验区,经过不断的攻关研究,二元驱现场试验取得了初步效果,但仍存在单井产液量低、地层压力