文昌鸡产自海南省文昌市,是海南省地方优良肉鸡品种,传统名牌产品,以其优良的肉质风味荣居海南“四大名菜”之首,在我国及东南亚国家均享有美誉,是海南饮食文化不可缺少的部分。本实验以文昌鸡作为试验样本,采用候选基因法,以GHR （intron 2、intron 5）、ESR462、ESR465、IGF-I五个基因座位作为候选基因,采用PCR-RFLP和PCR-SSCP方法对其进行了多态性分析。1.首次在文昌鸡中检测了与产蛋性能相关的五个候选基因座位的多态性。在这五个基因位点中,处于Hardy-Wenberg平衡状态的有两个,分别是ESR462 （5’ flanking region）、IGF （5′UTR）、非Hardy-Wenberg平衡状态的有三个:GHR442 （intron 2）、GHR436 （intron 5）、ESR465 （5’ flanking region）。其中ESR465 （5’ flanking region）位点未发现多态。2.初步确定了1个新的与鸡产蛋性能相关的分子标记,该标记位于ESR基因5’调控区域,对两种纯合基因型的片段进行回收、克隆、测序比较发现,ESR基因5’侧翼序列片段中第580位核苷酸AATA缺失,因而造成该基因5’侧翼序列的多态性。3.确定了2个与鸡产蛋性能相关的分子标记: ESR基因5’调控区域的SSCP位点、IGF-I基因5’非编码区域PstI酶切位点。4.对基因型与所检测个体相应的产蛋性能采用GLM分析进行遗传效应研究,结果表明:IGF-I基因对300日龄产蛋数有显著影响（加性作用）,IGF-I ^H2H2个体300日龄产蛋数与400日龄产蛋数分别比IGF-I^H1H1型个体高7.77% （P<0.05）和7.84% （P<0.05）;IGF-I ^H2H2个体300日龄产蛋数比IGF-I H1H2型个体高7.34% （P<0.05）;IGF-I ^H2H2个体平均连产天数分别比IGF-I^H1H1型个体和IGF-I H1H2型个体长0.42天（P<0.05）和0.60天（P<0.05）。结果显示,IGF-I基因以加性作用,其中300日龄产蛋数加性效应值为0.199 （P<0.05）。5.筛选出较优的分子标记:进行多个分子标记效应比较研究,确定了有利于产蛋性能提高和不利于产蛋性能提高的分子标记: ESR酶切基因位点基因型F₁F₃（88.59,134.95）、IGF-I酶切位点基因型H₂H₂（89.03,137.84）的300日龄、400日龄产蛋数都比较高,另外需要指出的是,ESR酶切基因位点基因型F₁F₃和IGF-I酶切位点基因型H₂H₂的平均连产天数分别达到3.56d、3.38d,显著高于其它基因型个体。