鸡肉IMP含量相关候选基因SNP筛查及其用于地方鸡种群体遗传结构分析的研究

来源 :扬州大学 | 被引量 : 23次 | 上传用户:gulingling
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
肌苷酸是影响肉品风味的重要物质基础之一。本研究以鸡肌苷酸合成代谢相关酶中的腺苷琥珀酸裂解酶(ADSL)基因、甘氨酰胺核苷酸合成酶(GARS)、5-氨基咪唑核苷酸合成酶(AIRS)和甘氨酰胺核苷酸转甲基酶(GART)基因为候选基因,在泰和乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡、藏鸡等4个地方鸡种以及1个外来鸡种一隐性白羽肉鸡群体中对鸡ADSL、GARS-AIRS-GART基因进行单核苷酸多态性(SNP)扫描并分析其与地方鸡种肌肉肌苷酸含量之间的关系:同时分别利用29对微卫星引物以及在两个候选基因ADSL、GARS-AIRS-GART中所检测到的15个SNP位点对我国的4个地方鸡种的群体遗传结构及遗传分化进行评估,主要结果如下: 1.以泰和乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡、藏鸡等4个地方鸡种与1个外来鸡种隐性白羽肉鸡12周龄母鸡为研究对象,比较了在相同的饲养管理条件下,不同品种鸡肌肉肌苷酸含量,发现了在不同鸡种的肌苷酸含量之间存在着显著差异(P<0.05),进一步证实了鸡肌肉肌苷酸含量受遗传因素的影响显著,这为进一步从分子水平探讨我国地方鸡种特异鲜味机理的研究奠定了基础,对于从育种角度开发利用地方鸡种资源也具有重要意义。 2.以鸡IMP合成代谢过程中的腺苷琥珀酸裂解酶(ADSL)基因为候选基因,采用PcR一ssCP结合序列测定的方法,在泰和乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡、藏鸡及隐性白羽肉鸡群体中对该基因的所有外显子与内含子的部分区域进行SNP扫描:(l)共检测出多态位点5个,分别为外显子2中的3484处C/T,内含子5中7426处的T/C,内含子6中7942处的G/C,外显子9中9839处的C/A以及内含子11中12546处的T/C。5个SNP位点分别命名为ADSLI、ADSLZ、ADSL3、ADSL4、ADSLS;(2)ADSL4位点的C~A突变为错义突变,导致对应的氨基酸序列的第273位氨基酸发生变异:脯氨酸(Pro)一苏氨酸(Thr),尽管该位点的基因型分布在不同鸡种间存在显著差异,但进一步的方差分析结果表明,该位点与胸肌肌昔酸含量之间并不存在关联;(3)其它4个SNP位点在5个鸡种中的基因型分布也存在显著差异,但仅ADSLI位点显示出与胸肌肌营酸含量之间存在着显著相关,其TT型(突变型)个体的肌普酸含量极显著地高于另外CT型与CC型个体(P<0.01),初步认为该位点可以作为肌肉IMP含量的辅助选择标记。3.以鸡IMP合成代谢过程中的甘氨酞胺核昔酸合成酶(GARS)一5一氨基咪吟核普酸合成酶(AIRS)一甘氨酞胺核昔酸转甲基酶(GART)基因为候选基因,采用PCR一SSCP结合序列测定的方法在泰和乌骨鸡、萧山鸡、白耳鸡、藏鸡等4个地方鸡种以及1个外来鸡种一隐性白羽肉鸡对该基因的5’侧翼序列的263bP的片段、所包含的21个外显子以及外显子/内含子的结合区域进行SNP扫描:(l)共检测出多态位点10个,分别为5’侧翼序列中的一179处的c/T,外显子3中的5669处的A/G,外显子4中6545处的C/A,内含子4中7777处的A/G,内含子6中10854处的G/T、10867处的e/T、10898处的G/A,内含子11中16297处的A/G,内含子14中21228处的C/T,外显子21中29686处的c/T。其中外显子4中的6545处的c~A突变导致对应的氨基酸序列中的第173位氨基酸发生变异:天冬氨酸( Asp)一谷氨酸(Glu);10个SNP位点依次命名为:GARSI、GARSZ、GARS3、GARS4、GARSS、GARS6、GARS7、GARSS、GARSg、GARS 10;(2)10个SN’P位点在不同的鸡种中的基因型分布差异显著(P<0.05),进一步的方差分析显示,GASRI位点以及GARS3位点与肌肉肌昔酸含量之间存在着显著的关联;(3)在所检测的5个群体中GARsl位
其他文献
Accelerated proximal gradient methods have recently been developed for solving quasi-static incremental problems of elastoplastic analysis with some different y
<正>城市轨道交通照明系统现状分析当前,每一盏LED灯具都需要配备一个AC-DC电源模块去驱动LED光源。其功能是EMC、整流和滤波、功率驱动、逆变降压、稳压稳流和功率因数矫正
以7-8成熟的芒果果实为材料,比较果实减压渗钙与否对后熟的效应,研究与果实后熟相关酶类的活性和CaM含量的动态变化,寻找它们之间的相互关系。结果表明:对照果实或者Ca2+处理果实
本研究用奶牛β-酪蛋白基因调控序列和人组织型纤溶酶原激活剂指形区缺失体(t-PA指形区缺失体)表达序列,构建了乳腺特异性表达载体pBC1-TPA和pBC2-TPA。在这两个载体中,插入人
创伤性脑损伤(traumatic brain injury,TBI)后颅脑多方式的监测,可以帮助医生及时了解患者脑部的重要病理生理及代谢变化和指导治疗,从而防止或减轻继发性脑损伤的发生发展,
应用智力量表和适应行为评定量表甄别弱智儿童龚建南,章希莹(长沙市卫生防疫站410005)根据《中华人民共和国义务教育法》,弱智儿童(MR)应有特殊教育学校(班)。目前,我市开设了特殊教育班,为了做
High-order accurate schemes are employed to numerically simulate the interaction of a supersonic jet and a co-directional supersonic inflow. A double backward-f
一项成功的创新战略需要在公司的正式和非正式组织间建立一种有意识的平衡关系。企业内这两种组织的平衡既有助于避免对平庸创意的处理不当,也能促进更多优秀创意的产生,并对其
The rock fragmentation involves the inter-block and the intra-block fracture.A simulation method for rock fragmentation is developed by coupling Voronoi diagram