环境因子对鼻咽部微生物多样性及群落结构的影响

来源 :郑州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhenlic0300
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:探索常见大气污染物及气象因素等环境因子,对健康个体及成人哮喘患者鼻咽部微生物(NPM)多样性及群落结构的影响规律,为呼吸系统疾病的防治提供科学依据。方法:本研究分为两个部分,第一部分研究环境因子对健康青年NPM的影响,第二部分研究环境因子对成人哮喘患者NPM的影响。(1)对郑州市某大学的在校生进行健康个体的鼻咽拭子采集和问卷收集,在2018年3月进行第一次采样并命名为春季组(S),在2018年9月进行第二采样并命名为秋季组(F),共纳入16例配对鼻咽样本(S组8例,F组8例);(2)对郑州大学第一附属医院呼吸门诊确诊的哮喘患者进行成人哮喘的鼻咽拭子采集和问卷收集,于2018年1-3月份进行第一次采样并命名为春冬季组I(W1),于2019年1-3月份进行第二次采样并命名为春冬季组II(W2),共纳入22例成人哮喘鼻咽样本(W1组9例,W2组13例)。其中包含发作期11例,缓解期11例。收集所有样本采样当天(D0)、采样前7天(D7)、采样前一个月(M)的环境因子数据(包括PM2.5,SO2,NC2,03,气温T,气湿H)。提取鼻咽拭子中微生物总DNA,采用Illumina Miseq平台对鼻咽部微生物16S rDNA的V3-V4区进行扩增测序,运用QIIME软件对序列信息进行处理,通过R软件和SPSS统计软件分析NPM组成、多样性和菌群结构,及其与各环境因子的关联。结果:1.S组与F组NPM之间β多样性具有显著差异(P=0.04),α多样性没有显著改变(P>0.05)。健康个体的鼻咽部核心微生物为:链球菌属,奈瑟氏菌属,嗜血杆菌属,啉单胞菌属,普氏菌属和梭杆菌属。2.组间差异分析表明:S组NPM中酸杆菌门,芽单胞菌门和共生小杆菌属丰度显著高于F组,而链球菌属,[Prevotella]和普氏菌属的丰度在F组中显著较高。RDA分析结果表明PM2.5和T是影响两组个体NPM群落结构差异的主要环境因子。相关性分析显示PM2.5与酸杆菌门,芽单胞菌门和共生小杆菌属呈正相关;T与链球菌属,[Prevotella]和普氏菌属呈正相关。3.W1组与W2组NPM之间α和β多样性均具有显著差异(P<0.05)。其中哮喘发作期和缓解期的α和β多样性均无明显差异(P>0.05)。成人哮喘的鼻咽部核心微生物为:链球菌属,奈瑟氏菌属,普氏菌属,梭杆菌属,嗜血杆菌属,颗粒链菌属和韦荣氏球菌属。4.组间差异分析表明:W1组NPM中链球菌属,嗜血杆菌属,放线杆菌属和[Prevotella]的丰度显著高于W2组,而罗斯氏菌属,放线菌属,栖热菌属,梭杆菌属,贪铜菌属,纤毛菌属和不动杆菌属的丰度在W2组中显著较高。PLS-DA分析指出链球菌属,罗斯氏菌属,放线菌属和栖热菌属对群落结构差异的影响最显著(VIP>2.0)。RDA分析结果表明NC2和O3是影响两组个体NPM群落结构差异的主要环境因子。相关性分析显示罗斯氏菌属,放线菌属和栖热菌属与N02呈正相关,与03呈负相关。链球菌属与N02呈负相关,与03呈正相关。5.RDA分析结果还表明环境因子对NPM群落结构的影响具有协同和拮抗作用,NPM受多种环境因子共同影响。相关性分析发现采样前一个月(M)的环境因子与更多的NPM相关,对NPM菌群的影响要大于采样当天(D0)和采样前七天(D7)环境因子的影响,提示环境因子对NPM的影响可能具有滞后效应。6.成人哮喘患者NPM的α多样性要高于健康个体(P=0.014),但β多样无显著差异(P=0.143)。颗粒链菌属和韦荣氏球菌属可能与哮喘疾病相关。结论:1.不同季节间环境因子变化可能显著改变健康个体及成人哮喘患者NPM的组成,多样性和群落结构。2.春季与秋季间PM2.5浓度和T的改变可能是影响健康个体NPM群落结构的主要环境因子,并与特定菌群显著相关。3.春冬季里N02和03浓度的改变可能是影响成人哮喘患者NPM多样性及群落结构的主要环境因子,并与特定菌群显著相关。4.环境因子对NPM多样性和群落结构的影响可能是多个环境因子协同或者拮抗作用于菌群引起。
其他文献
快中子临界装置上中子动力学参数的测量是了解临界装置动力学特性的一种重要的手段。基于时间概率分布测量动力学参数的方法要求探测器具有响应时间快、n-γ甄别性能好以及探
第一部分:胎鼠肺泡Ⅱ型上皮细胞的原代培养及鉴定目的:建立原代培养的方法,即从孕19天胎鼠体内分离、纯化、培养获取胎鼠肺泡 Ⅱ 型上皮细胞(Fetal alveolar type Ⅱ epithel
社会的快速发展导致底泥重金属污染问题越来越严重。疏浚技术具有很强的可操作性和丰富的工程实践经验,是目前应用最为广泛的河道内源污染治理技术。同时,堆肥技术被认为是对
对不同大豆品种的耐盐碱能力进行综合评价,筛选出相对耐盐碱的大豆品种,进一步对耐盐碱和盐碱敏感大豆品种进行转录组分析,从而为盐碱地有效利用和探索大豆耐盐碱机理提供实
在农业生产中,准确确定作物蒸腾蒸发量(ETc)对于制定科学合理的灌溉制度和提高农田水分利用效率具有重要意义。ETc主要包括植株蒸腾(Tr)和土面蒸发(Eg)。Tr与作物的干物质积累相关,
目的探讨骨髓间充质干细胞(Bone marrow mesenchymal stem cells,BMSCs)及其源性外泌体(exosome,EXO)对化疗性卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)的修复作用及机制。方
本论文对两种肉豆蔻科植物琴叶风吹楠(Horsfieldia pandurifolia)和红光树(Knema furfuracea)进行了化学成分的研究。从中共分离和鉴定了76个化合物,其中有6个新化合物。琴叶风吹楠是云南特有植物。到目前为止,国内外学者对其研究并不深入,集中在种子的含油量及成分分析,对非油脂部分研究未见报道。自2014年起,本课题组研究生分别在滇南风吹楠(H.tetratepala
先兆子痫也称子痫,是一种严重的母婴并发症。患者妊娠20周后出现血压增高、蛋白尿、水肿等表现,严重患者甚至可以出现头痛、眼花、恶心、呕吐等症状,病因至今尚不清楚,目前除
目的:运用MIMICS软件重建正常骨盆的三维模型,模拟螺钉植入骨盆模型分析LC-Ⅱ螺钉通道及通道各项参数,为临床螺钉植入提供理论依据。方法:收集我院2016年9月至2018年12月正常
目的:本研究旨在观察不同尿蛋白排泄水平的2型糖尿病(T2DM)患者血清Betatrophin水平,并进行相关因素分析,探讨Betatrophin与相关代谢参数及尿蛋白水平的相关性。方法:本研究