在饮用水里存在的病原原生动物中,隐孢子虫和贾第鞭毛虫的危害一直受到国际社会的广泛关注和高度重视。饮用了含有这些原虫卵囊或孢囊的水可引起严重的消化道感染,甚至死亡。近年来,随着我国人民生活方式的改变,越来越多的人直接饮用生水,因此“两虫”问题对饮水者造成了严重的健康威胁。目前,EPA1623方法是国际上检测“两虫”最为成熟和权威的方法之一,但是该方法存在成本高、回收率低的局限性,因此本课题组在EPA1623的基础上对“两虫”的检测方法进行优化研究,研究出适合我国国情的优化方法,并将此优化方法运用于上海市各自来水厂的水源水以及处理工艺出水的检测。为了建立有效的分析检测,本项研究对EPA623的三大步骤过滤浓缩、免疫磁分离(IMS)和荧光免疫监视检视(FA)进行了分步回收率分析,得出过滤浓缩阶段是导致回收率损失的主要步骤,并提出了以国产滤囊+超声洗脱替代Envirochek滤囊+震荡洗脱、滤膜过滤+超声分离替代离心分离为技术关键的优化过滤浓缩步骤。实验得出超声洗脱和分离的最佳超声频率为60KHZ、超声时间为15分钟,水温为40°C。采用国产滤囊+超声洗脱+滤膜过滤+超声分离+IMS+FA的优化两虫测试方法,可以使EPA1623两虫测试方法回收率的低限由20%左右提高到50～60%;单次测试成本下降50%;设备一次性投资下降30%。在此基础上,我们运用优化的两虫检测方法对上海市饮用水源水、自来水厂出水和自来水处理过程中的沉后水、滤后水中的贾第鞭毛虫和隐孢子虫的污染状况进行了调查检测。结果表明上海自来水厂水源水中普遍存在“两虫”,且贾第鞭毛虫的密度维持在0～5个/10L,隐孢子虫的密度维持在0～3个/10L,但所选取的水厂出厂水、沉后水以及滤后水中均未检出两虫。在自来水处理工艺中,混凝沉淀对两虫具有明显的去除效果,是去除贾第鞭毛虫和隐孢子虫的重要阶段。