南海北部蓝圆鲹群体遗传学研究

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蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)是我国重要的海洋经济鱼类之一,在我国近海均有分布,以南海北部的资源量最高。近年来,由于南海北部渔业捕捞压力不断增大,海洋生态破坏和环境污染日趋严重,蓝圆鲹的种群生物学特征发生显著变化,其资源衰退明显。因此,迫切需要对南海北部的蓝圆鲹群体遗传特性和种质资源状况进行研究。本研究首次采用SLAF-seq技术开发蓝圆鲹微卫星DNA(SSR)标记,并对南海北部8个蓝圆鲹群体进行遗传学分析,系统评估南海北部蓝圆鲹种群的遗传资源状况和全面解析其遗传结构,为蓝圆鲹种群资源的科学保护与合理开发提供指导和理论依据。研究主要结果如下:(1)基于高通量测序平台的SLAF-seq技术,在蓝圆鲹基因组DNA中共获得了28905个一至六碱基重复微卫星位点。其中单碱基重复微卫星位点8138个(28.15%),二至三碱基重复微卫星位点分别为13590个(47.02%)和5727个(19.81%);四至六碱基重复微卫星位点数量相对较少,分别为1104个(3.82%)、234个(0.81%)和112个(0.39%)。从这些位点中随机挑选225个二至六碱基重复微卫星位点,最终成功筛选出80个多态性SSR位点。(2)80个SSR位点在广东汕头近岸32个蓝圆鲹个体中共扩增出1086个等位基因。各位点的等位基因数(Na)为4~19(均值为14),表观杂合度(Ho)为0.2333~1.0000(均值为0.7038),期望杂合度(He)为0.3735~0.9588(均值为0.8370)。80个位点中有78个位点属于高度多态(PIC≥0.5),2个位点为中度多态(0.25
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