酿酒酵母染色体重塑复合物ISW1a的结构生物学研究与蛋白质X射线晶体学中的数据分析

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表观遗传学是研究不依赖于DNA序列变化的遗传机制的学科。许多生物学现象受表观遗传机制的调控,例如雌性X染色体的失活、花的形态等。染色体重塑过程是调节表观遗传相关过程的重要手段。染色体重塑是指通过动态调节染色体的结构从而控制基因的表达。有两类蛋白主要参与染色体重塑过程:组蛋白修饰酶(例如组蛋白乙酰化酶、组蛋白甲基化酶等)和ATP依赖的染色体重塑复合物。染色体重塑复合物可以分为SWI/SNF、ISWI、CHD、INO80四大类家族,它们具有相似的ATPase结构域,通过水解ATP释放的能量改变核小体的结构。我们以酿酒酵母染色体重塑复合物ISW1a为研究对象,对其进行了初步晶体学分析。   X射线晶体学是测定生物大分子三维结构的主流手段。晶体中的原子与X光相互作用可以在某些特定的方向产生衍射线。通过测量这些特定方向衍射点的强度我们可以计算出晶体中的电子密度图,从而推演出晶体中的原子位置。实验中我们只能测量到衍射点的强度信息,而丢失了其相位信息。目前主要有实验相位法和分子置换法解决相位问题。随着第三代同步辐射的发展,单波长反常散射法已成为实验相位法中的主流。我们以解析的八个晶体结构来阐明单波长反常散射法和分子置换法的应用和技巧。
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