高技术产业做为国民经济发展的战略性先导产业，在经济发展方式转变以及产业结构调整过程中发挥着不可替代的重要作用。大力发展高技术产业，加强高技术产业技术创新，能够进一步有效地推进我国建设成为创新型国家的进程。近几年高技术产业技术创新资源的投入日益增多，如何有效地利用投入的创新资源，成为各级政府部门关注的焦点，因此有必要对我国高技术产业技术创新效率的变化趋势进行研究。首先，本文对国内外有关技术创新效率的研究视角和评价方法进行了文献研究。其次，界定了技术创新、效率等概念。再次，对我国高技术产业的生产经营情况、技术创新投入产出现状进行了描述性分析。然后，利用SPSS18.0对通过文献回顾筛选出的指标进行相关性分析，剔除相关性较高的指标，构建三投入、两产出的高技术产业创新效率评价指标。最后结合2004～2010年我国高技术产业原始数据，分别建立DEA模型和Malmquist指数分析模型，利用DEAP2.1软件对我国高技术产业技术创新效率进行了评价，结合评价结果使用纯技术效率和规模效率两个指标对我国高技术产业技术创新效率进行了静态分析；用技术效率变化指数和技术进步变化指数两个指标对我国高技术产业技术创新效率变化情况进行了动态分析。技术创新效率静态分析结果表明：2010年我国各省市高技术产业和高技术产业分行业之间技术创新效率存在明显差异。技术创新效率动态分析结果表明：2006年～2010年我国高技术产业技术创新效率平均每年提高10%，其中技术效率变化指数年均提高12%，而技术进步变化指数年均降低2%。说明“十一五”期间我国高技术产业技术创新效率得到明显的改善，但是我国高技术产业出现技术衰退，技术创新效率的提高主要得益于技术效率的提高。