理性设计盐桥构建伯克霍尔德菌脂肪酶热稳定突变体

来源 :福建师范大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:ntfan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
伯克霍尔德菌(Burkholderia sp.)ZYB002脂肪酶A欠佳的温度耐受性限制其使用效果和应用范围。提高酶蛋白的稳定性,对延长酶蛋白的货架半衰期,提高酶反应速率等具有重要的意义。本文借助FoldX、Rosetta和YASARA等软件,构建了脂肪酶LipA的热稳定性突变体电子文库。然后,结合LipA的3D结构信息,利用YASARA软件分析上述突变体电子文库,筛选出具有盐桥效应的突变体;利用定点突变技术构建具有盐桥效应的突变体,并测定其突变效应;筛选出热稳定性提高的突变体;并进一步构建叠加突变体(本课题组先前筛选出的部分热稳定性提高的突变体),筛选出热稳定性显著提高的突变体。具体实验结果如下:1.利用YASARA软件确定Burkholderiasp.脂肪酶LipA的活性中心区域,予以保护。使用FoldX和Rosetta软件对LipA活性中心保护区域以外的氨基酸位点进行虚拟饱和突变,根据突变前后解折叠自由能的变化值以及利用YASARA软件对各个突变体进行结构合理性目检,筛选出潜在的热稳定突变体,构建了一个包含341个突变体的电子文库。2.通过YASARA软件的“show interaction”功能,从上述突变体电子文库中筛选出27个存在盐桥效应的突变体。由于其中某些位点是突变成同种性质的氨基酸或引入突变后造成插入突变,因此实际成功构建了 20个突变体。经过诱导表达和热稳定性分析后,从20个突变体表达蛋白中筛选出3个热稳定性有明显提高的突变体:LipA-N125D、LipA-N125E和LipA-Q262E。相对于野生型脂肪酶LipA,它们的热半失活温度T5012值较野生型分别提高了 4.0℃、5.5℃和4.4℃;在55℃热处理下,半衰期较野生型分别提高了 1.2倍、2.8倍和1.6倍。3.从本课题组前期构建的五个饱和突变文库中,挑取热稳定性提高最为明显的突变体(LipA-E35P、LipA-L218E、LipA-V220E、LipA-F221D 和 LipA-V223D)与上述三个突变体(LipA-N125D、LipA-N125E和LipA-Q262E)分别进行叠加突变,构建了15个阳性双突变体。通过热稳定性分析,15个双突变体的热半失活温度T5012值较野生型都有明显的提高,提高的幅度从5.5 ℃(LipA-V223D/N125D)到11.1 ℃(LipA-F221D/N125E);半衰期较野生型提高幅度从 2.1 倍(LipA-V223D/N125D)到 49.57倍(LipA-F221D/N125E)。
其他文献
2008年7月25日,在黄河水院新校区行政楼二楼会议室,我院院长刘宪亮、副院长刘紫婷与菲律宾亚当森大学副校长Ms.Ana Liza Ragos、后勤处处长Ms.Rosalina Cabanag、工程系副主任Dr.R
按照职业教育培养一线实用性人才的要求,以道路桥梁专业为例,结合本专业“道路勘测与施工放线”一线职业技能的要求,从培养目标的制订、课程体系的改革、实践教学环节的设计
2001年4月《中华人民共和国婚姻法》修正案(以下简称《婚姻法》)第40条规定了夫妻财产制在属于分别财产制下承担较多家事劳动的一方在离婚时享有经济补偿的权利,明确承认了家事
在当今信息社会和知识经济时代,传统教育由于沿袭前苏联僵化的教育体制与结构,教育发展严重滞后,在数学学科教育方面表现尤为突出。僵化的教材和陈旧的教法,造成创新人才的培养和
目的通过验证SPSS软件分析实现配对四格表资料的统计分析两种方法的一致性和相关主要结果的解读。方法SPSS软件提供两种方法可进行配对四格表资料的统计分析,一是列联表资料
【正】 编辑同志:贵刊展开关于客观规律和主观能动性问题的讨论,我认为这不论从理论意义来说或从现实意义来说,都是非常必要的.不过,我觉得,为了把这一问题讨论得好,讨论的范
基于教学实践,分析了工程制图与计算机绘图西门课程融合的必要性和可能性,从多个方面深入探讨了实现融合的空间,明确了存在的问题,提出了实现融合的模式。
在网络的组成中,可以说双绞线是最基本的部分,可以说涉及到网络的每个环节。从布线、网线制作、水晶头压制等各个环节,都是看起来最不起眼的地方,但是却对网络的正常运转起着
2006年11月13日,教育部宣布国家“高职211”工程(困家要在“21世纪建设100所示范性高等职业院校”)正式启动。经过教育部、财政部联合组织的专家组评审,于2006年12月5日在北京公