数码显微系统是将光学显微技术、数据采集技术以及计算机处理和控制技术结合在一起发展形成的，是对传统光学显微镜功能的一次延伸，能显著的改善显微图象的分辨率和对比度，在生物、医学、工业质量检测等领域都有着广泛的应用。 论文共分六章。第一章是绪论；第二章是对系统的总体介绍；第三章介绍了系统软件模块的基本概念和相关算法研究；第四章是有关二维层析数据可视化的内容；第五章是对我们开发的软件系统功能的总体介绍；第六章是总结和展望。 本论文首先回顾了当前国内外数码显微系统发展的现状，得出结论：国内对数码显微系统的研究，特别是对其中图象处理和分析软件的开发上，始终不能保持与世界同步。鉴于这种现状和市场的需求，确定了我们下一步努力的方向。接下来我们从总体上介绍了数码显微系统的组成，将数码显微镜的设计分成光学成像、数据采集以及图象处理和分析三个既相互独立又紧密联系的模块。而我们的重点是图象处理和分析模块。在此模块中，针对显微图象的特点，除了编制完成了图像处理中的一些常见的算法，如基本的滤波与图像增强、图像交互分割、窗宽与窗位调整、图像算术运算、灰度图的三维显示、剖面线、位图分析、图像标注、图像编辑等功能。另外我们还实现了：直方图的局域均衡化和匹配算法，并将其扩展到彩色空间中；图象的自动调整算法，包括AutoContrast，AutoLevel，AutoColor；灰度空间和彩色空间的各种形态学算法；细化算法；距离算法；浮雕算法；细胞计数算法等有特点的功能。同时，我们还在软件中增加了测量功能，使整个软件具有了定量分析的能力。通过集成的图象浏览和数据库，可以方便的实现对图象的管理。 在二维图象处理和分析功能的基础上，成功地实现了层析CT和PET数据的三维快速显示、三维数据场的再切片以及交互操作，实现了AXIAL、SAGITTAL、CORONAL三个切片坐标的切割。 本软件因其具有的功能强大、运行稳定、性价比高等特点，已投入市场运作并取得了良好的效果。