以RAPD技术克隆大分子抗肿瘤抗生素C1027生物合成基因

来源 :中国协和医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:colawing1
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C1027是从链霉菌S.globisporus C1027代谢产物中筛选出来的一种新型抗肿瘤抗生素,对体外培养的肿瘤细胞及小鼠移植性肿瘤具有强烈的杀伤作用,C1027结构由一个发色团和一个酸性蛋白组成,该抗生素的抗瘤活性在于其以九员烯炔环为中心的发色团,蛋白部分起稳定、保护和控制发色团释放的功能。本工作的初期曾花相当的精力以辅基蛋白基因为探针探测发色团的生物合成基因但未获成功。现在我们采用随机扩增的多态性DNA(RAPD)方法克隆其生物合成基因。自1990年RAPD技术首次问世以来在分子生物学领域得到了广泛应用,但利用它进行基因克隆未见报导。 提取C1027产生菌及经吖啶黄诱变筛选出的5种C1027阻断变株染色体DNA作为扩增模板,人工合成7种寡核苷酸引物,长10bp,GC含量60-70%,碱基序列完全随机,此外又选用了其它实验使用过的三种17-30bp寡核苷酸引物。我们建立了可重复、能产生多态性的RAPD反应条件。分别以单个寡核苷酸引物对C1027原株及5种变株的总DNA进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳比较原株与变株扩增产物的差异。一种引物扩增得到的DNA片段数在0-5之间,大小在300-1200bp之间,就一个给定的引物而言,一种菌株产生的RAPD图谱是特异的,可重复的。我们发现在相同的引物下,原株与变株的扩增图谱相似但有差异。 比较原株与变株的RAPD图谱,有雨种引物扩增出原株特异而变株AF67缺失的片段,大约分别为900bp(F2)和700bp(F7)。由于同一种引物下RAPD图谱的差异反应了模板DNA核苷酸序列的不同,因
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