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背景和目的:食管癌是全世界最常见的消化道恶性肿瘤之一,其发病率及死亡率居高不下。食管癌具有两种主要的病理类型:食管鳞状细胞癌（Esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）和食管腺癌（Esophageal adenocarcinoma,EAC）;其中ESCC占到80%的全球发病病例,是亚洲国家的主要亚型。早期食管癌症状不明显,大部分患者就诊时已处于Ⅱ期,甚至更晚;因此食管癌的主要研究集中在局部晚期（Ⅱ-Ⅲ期）的治疗。根治性放化疗（Definitive chemoradiation,d CRT）是局部晚期食管癌标准治疗方案,但是治疗后局部复发是这种治疗模式失败的主要原因。凋亡和自噬在细胞的生长、发育中扮演非常重要的角色,甚至与恶性肿瘤的发生发展也有密不可分的关系。经根治性放化疗治疗后,患者出现局部复发的原因与细胞的凋亡和自噬是否有明确关系,目前没有相关研究证实。因此,本研究通过检测根治性放化疗后食管鳞癌患者原发和局部复发肿瘤配对样本中与凋亡和自噬相关的基因,进一步探讨根治性放化疗后食管鳞癌局部复发与凋亡和自噬功能障碍的关系。方法:回顾性分析2002年3月至2012年9月期间行根治性放化疗治疗的局部晚期食管鳞癌患者临床资料。在随访过程中,经CT（computed tomography）、消化道内窥镜和病理活检检查证实局部复发的患者纳入研究,并将根治性放化疗前食管鳞癌原发肿瘤的石蜡包埋组织与局部复发后的肿瘤组织进行相关检测和分析。结果:第一部分:共有126例患者纳入最终研究,其中男性患者90例（71.4%）、女性患者36例（28.6%）;Ⅱ期患者有60例（47.6%）,Ⅲ期患者66例（52.4%）。1年、3年和5年局部无复发生存率（local recurrence-free survival,LRFS）分别是54.8%、19.8%和14.3%,中位LRFS为13个月。与T3-4期患者相比,T2期患者的LRFS时间有较为明显的延长,中位LRFS时间分别是10.1个月和15.5个月（P=0.007）;与Ⅲ期患者相比,同样Ⅱ期患者的LRFS时间明显长于Ⅲ期患者,中位LRFS时间分别是10.6个月和19.0个月（P=0.001）。性别、年龄、原发肿瘤位置、肿瘤病理分化等级和淋巴结是否有转移与LRFS时间之间无明显关系。第二部分:在局部复发肿瘤与配对原发肿瘤样本的比较中,发现凋亡机制关键基因表达谱在局部复发肿瘤有5个上调和7个下调的相关凋亡基因,其中CD40、TRAF4和BCL2A1上调与CARD6和TNFRSF21下调与早期局部复发风险增加相关。CD40高表达组患者LRFS时间明显低于低表达组,两组中位LRFS时间分别为11.0个月和16.5个月（p=0.05）。在TRAF4高表达的42例患者中,经根治性放化疗后,有32例（76.2%）患者在24个月后发生了局部肿瘤复发;在TRAF4低表达的24例患者中,有14例（50%）患者在同一时间出现了局部肿瘤复发;两组中位LRFS时间分别是10.6个月和19.0个月（P=0.018）。与BCL2A1高表达组相比,低表达组的中位LRFS时间明显延长,两组中位LRFS时间分别是9.0个月和16.5个月（P=0.035）。与CARD6低表达组相比,高表达组的中位LRFS时间明显延长,两组中位LRFS时间15.5个月和11.0个月（P=0.038）。在37例TNFRSF高表达的患者中,20例（54.1%）患者出现了局部肿瘤复发;而在32例TNFRSF低表达的患者中,26例（81.3%）患者均在24个月之后才出现局部肿瘤复发;两组中位LFRS时间分别是21.0个月和9.0个月（P=0.001）。BCL10,BIRC3,TNFRSF10A,AKT1,BAG4,BFAR,CASP8和LRFS的表达水平与局部肿瘤复发没有明显的相关性。第三部分:与配对原发肿瘤组织相比,局部复发肿瘤组织中可以观察到较多的自噬溶酶体结构形成,而在原发肿瘤组织中仅偶尔可观察到自噬溶酶体。通过免疫组化及蛋白免疫印迹法检测LC3-Ⅱ在配对肿瘤样本中的表达,结果发现局部复发肿瘤组织中LC3-Ⅱ蛋白表达高于配对的原发肿瘤组织。与LC3-Ⅱ表达阳性的患者相比,LC3-Ⅱ表达阴性患者的LRFS明显延长,中位LRFS达13.7个月（P=0.002）。在Ⅱ期患者中,LC3-II表达阴性的患者LRFS中位时间为25.0个月,而LC3-II表达阳性的患者LRFS中位时间只有13.5个月（P=0.004）;在Ⅲ期患者中,LC3-II表达阴性的患者的2年和3年局部无复发生存率也明显优于LC3-II表达阳性的患者,虽然没有统计学差异（P=0.152）。结论:局部晚期食管鳞癌患者经根治性放化疗治疗后,早期局部复发与细胞凋亡和自噬功能障碍之间具有一定关系,为今后食管鳞癌的治疗和研究提供了新的思路,但需要更多研究去了解食管癌复发的生物学机制。