自然资源特许权制度是一项重要的权利制度。该制度以行政相对人的申请为前提，以政府依法审查为关键，其核心在赋予申请人其原本不拥有的进行自然资源开发利用以及获取利益的权利和资格。本文从行政法学与资源与环境保护法学的复合视角出发，以资源特许权保障为目的，对自然资源特许权性质、取得原则与方式、其流转及征收保障加以探讨。将自然资源特许权性质界定为“准物权"之一种，其取得应主要采取市场化的竞争方式。文章重点以山西省“煤矿整合”运动为例，对基于公益目的强制征收自然资源特许权应予以合理补偿加以论述。从而得出结论，我国应借鉴西方国家司法介入征收补偿程序的经验，实体上建立自然资源特许权征收公益目的认定程序，完善自然资源特许权征收补偿金确定程序；程序上完善自然资源特许权征收中公众参与制度和公民权益保障制度，对自然资源特许权征收过程中资源特许权人的知情权、参与权、听证权等作出明确的救济性法律规定，以保障资源特许权人的合法权益。