经过近30年改革和发展,中国的民营经济已经成为国民经济的重要组成部分,成为国民经济最为活跃的亮点。现阶段,很大一部分民营企业已经发展到二次创业阶段,其发展遇到了“规模”和“寿命”两个瓶颈,造成这些瓶颈的原因有很多,如政策性因素、行业不景气、资金实力不够等等,但更加共性的原因是民营企业内部的组织架构没能很好的支撑企业进一步发展。本文借鉴杰姆斯等人对组织架构的界定,结合我国的实际情况,将决策权力分配机制、报酬激励机制和监督约束机制作为组织架构的关键方面进行阐述。文章首先简要阐述了组织架构涉及的基础理论,提出现代企业构建组织架构的理论分析框架,即必须确保组织架构的决策权力分配机制、报酬激励机制及监督约束机制的有效协调运行,为分析处于二次创业阶段的民营企业提供理论分析框架。然后结合我国实际情况阐述了二次创业期民营企业组织架构的现状及问题,并从我国传统文化特点、民营企业自身因素和职业经理人的因素三方面分析了存在问题的原因。最后提出了优化民营企业组织架构的对策和建议:在决策权力分配方面,民营企业应当根据所处行业的特点、技术水平状况及政府干预程度来决定集权与分权的度,同时提出了团队决策是实现决策权力分配的有效途径,在权力分配时,要确保决策管理权和决策控制权由不同的决策者承担,同时还要优化决策机制,实现科学决策;在报酬激励机制方面,坚持物质激励与精神激励相结合,同时配合晋升、培训机会等其它激励方式;在监督约束机制方面,要构建科学的绩效管理评估体系,确保员工按照业绩情况得到报酬,通过公司章程、聘任合同及发挥“三会”的作用来强化内部监控,通过加快外部的法律、道德、制度建设来完善外部监督机制。