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以文昌鸡作为试验样本,采用候选基因法,以GNRHR、NPY、GHR (intron 2、intron 5)、PRL、ESR462、ESR465、IGF-I、TGFβ-2、TGFβ-3、TGFβ-4十一个基因座位候选基因,以及鸡2号、4号、Z染色体上20个微卫星标记进行鸡产蛋性能和蛋品质性状分子标记研究。1.首次在文昌鸡中检测了与产蛋性能相关的十一个候选基因座位的多态性。在这十一个基因位点中,处于Hardy-Wenberg平衡状态的有六个,它们分别是GNRHR (intron 1)、NPY (TSS)、PRL450 (intron 1)、ESR462 (5’ flanking region)、IGF (5′UTR)、TGFβ-3 (intron 4);非Hardy-Wenberg平衡状态的有五个:GHR442 (intron 2)、GHR436 (intron 5)、ESR465 (5’ flanking region)、TGFβ-2 (Promoter region)、TGFβ-4(exon 1)。其中ESR465 (5’ flanking region)、TGFβ-2 (Promoter region)、TGFβ-4(exon 1)位点中未发现多态。2.初步确定了1个新的与鸡产蛋性能相关的分子标记,该标记位于ESR基因5’调控区域,对两种纯合基因型的片段进行回收、克隆、测序比较发现,ESR基因5’侧翼序列片段中第580位核苷酸AATA缺失,因而造成该基因5’侧翼序列的多态性。确定了4个与鸡产蛋性能相关的分子标记:GNRHR基因内含子1处的Bpu1102I酶切位点、NPY基因转录起始区域的DraI酶切位点、ESR基因5’调控区域的SSCP位点、IGF-I基因5’非编码区域PstI酶切位点;3个与鸡蛋品质性状相关的分子标记:GHR基因内含子5的NspI酶切位点; IGF-I基因5’非编码区域PstI酶切位点;TGFβ-3内含子4的BslI酶切位点。