宫颈癌是女性生殖系统最常见的恶性肿瘤之一。每年全球新发病例超过50万,且其中80%来自发展中国家。根据中国卫计委官方网站公布的2011年卫生统计年鉴数据显示,我国2010年宫颈癌总患病率为15.1/10万人,与往年相比呈上升趋势。宫颈癌以鳞癌为主,其次为腺癌,有文献报道同期的宫颈腺癌与宫颈鳞癌相比生存率更低,预后更差。流行病学调查研究显示,高危型人乳头瘤病毒(Human papillomavirus, HPV)感染是宫颈癌发生的重要启动因子。乳头瘤病毒是增殖在皮肤和粘膜层状细胞上的一种小DNA病毒。按照临床分析,人乳头瘤病毒可以分为高危型和低危型两大类。高危型HPV或称致瘤HPV能够导致癌症；目前已经鉴定出了12种以上的高危型HPV,其中HPV16和HPV18与约70%HPV引起的宫颈癌有关。虽然过去的研究已经明确了高危型HPV与宫颈癌之间的相关性,然而对于高危型HPV的致癌机理,尚缺乏对HPV病毒影响宿主细胞的宏观认识。而伴随着测序技术和高分辨率质谱技术的日益成熟,人们有机会通过高通量测序和全蛋白质谱分析等手段对HPV的致癌机制进行更为全面的认识。据此,我们将上述两种新技术与其他分子生物学技术整合应用,获得了宫颈癌,HPV表达细胞和宫颈癌细胞系的转录组,蛋白组信息,并对HPV在以上两个层面所发挥的致癌作用进行了初步的探究。目的：获得宫颈癌组织样本或HPV癌基因表达细胞/宫颈癌细胞系的转录组,蛋白组信息,比较它们与正常组织或正常细胞系之间的差异,并检测HPV与这些差异之间的相关性。方法：1.对HPV癌基因细胞系进行RNA测序：对稳定表达高危型HPVE7基因的NIKS-E7及其对照NIKS-Vector细胞进行RNA提取,对所得RNA进行测序并定量。2.对RNA测序结果进行生物信息学分析：从RNA测序的结果中挑选出E7细胞与Vector细胞有明显表达差异,且能够表达为蛋白的基因。对这些基因进行GO (Gene Ontology)聚类。并用RTq-PCR验证RNA测序结果准确性。3..对宫颈癌细胞系进行蛋白样本制备：分别从宫颈鳞癌SiHa和宫颈腺癌HeLa细胞系中提取细胞全蛋白,并用FASP方法进行蛋白酶解。4.对宫颈癌细胞系进行蛋白组分析：将上述两种细胞系的肽段进行LCMS分析,并对所得质谱数据进行非标记定量,对定量数据进行生物信息学分析。结果：1.经过RNA测序,共发现236个基因在有HPV癌基因E7的细胞中与对照细胞相比存在明显差异表达,其中高表达基因150个,低表达基因86个2.经过GO聚类分析,高表达基因中38%与细胞周期相关,30%与DNA代谢相关；低表达基因中约15%与细胞增殖调节相关,14%与细胞稳态相关。3.经过质谱分析,在HeLa和SiHa之中共鉴定到2373种蛋白,其中在HeLa细胞中共鉴定到符合多肽可信度假阳性率(FDR)≤0.05的蛋白1401种。在SiHa细胞中共鉴定到符合多肽可信度FDR≤0.05的蛋白1620种。4.在上述蛋白中,在两种细胞中有明显表达差异的蛋白,满足p≤0.05的蛋白共787种,其中HeLa高表达蛋白401种,HeLa低表达蛋白386种。HeLa高表达蛋白中有10.8%的蛋白与提高产能代谢相关,在Hela低表达的蛋白中,有14.3%的蛋白同调节细胞凋亡相关。结论：1.HPV癌基因能够促进细胞增殖和细胞代谢,从而促进癌症的发生。2.HPV感染所导致的腺癌和鳞癌有明显的蛋白表达差异,这些差异很可能是导致腺癌预后不良的重要原因。