“物流”这一概念从上世纪八十年代引入我国至今，已经取得了巨大的发展。在经历了从认识到实践，再从实践中重新认识的不断反复后，随着政府职能部门、运输企业和整个社会大环境对物流在国民经济中重要性认识的不断加深，如何克服现有的缺点，突破原有体制的束缚，建立一个跨区域、跨行业的一体化交通运输物流框架体系，为我国物流业的健康发展提供深层次的动力，已经成为我们面临的一个主要问题。 本文旨在通过广泛的调查研究和文献资料的收集整理，充分分析了我国交通运输物流管理组织构架中各主要机构的职能、作用、运作模式和协调机制，以及相关协会组织的建设现状；在此基础上引入协同学理论，分析交通运输物流中的协同机理，结合我国实际情况以及交通运输业物流发展态势、目标研究，设计我国交通运输物流管理组织构架的协同模型，探讨并提出相关对策和建议，主要包括物流综合管理的政府机构设置与运作机制以及物流行业协会的建设，建立交通运输物流发展中政府与企业、行业协会间的协同关系，对我国的物流系统规划和政策实施进行宏观控制的有效机制。