随着经济的高速发展,区域协同创新方面的研究已成为理论方面和实践方面研究的重点。在理论研究方面,诸多学者试图从区域协同创新系统的内涵、构成和组成要素等角度出发,深入剖析系统的运行机理和运行状况,以丰富相应的理论研究;在实践研究方面,各级政府正试图努力研究,如何更为有效地调动区域创新主体间的协同创新积极性,以加快区域协同创新系统建设进程,为经济的发展助力。所以,无论是从理论角度来看,还是从实践角度来看,对区域协同创新系统的研究都是极具重要意义的。本文立足于区域协同创新系统的内涵和特征,拟对其系统评价方面的内容进行研究。为了解区域协同创新系统的发展水平及态势,需要基于系统特征建立动态评价模型。故本文以区域协同创新系统为研究对象,采用先初选指标再运用聚类分析和指标相关性分析的方法筛选指标,以建立系统评价指标体系,提出从系统内部和外部两个角度出发,运用Topsis-灰色关联动态耦合模型和能力结构关系模型构建区域协同创新系统动态评价模型,并借此对2011~2016年我国30个省、自治区和直辖市的区域协同创新水平进行实证研究。结果显示:一方面,我国区域协同创新系统的发展水平在空间分布上,表现出“东高西低”的非均衡差异,且整体呈“升—降—升”的发展态势,三大区域的内部差异和外部差异对整体差异的影响大致相同,而东部地区的内部差异却尤为突出;另一方面,从整体上看,我国区域协同创新系统发展水平在空间上表现出正的集聚现象,空间格局层次分明,其相关性呈“倒U”发展特征,从局部上看,高高集聚区域主要集中在东部沿海地区,低低集聚区域主要集中在中西部和西北地区,而低高集聚区域和高低集聚区域分布较为分散,但总体来看,随着时间的推移,空间格局表现较为稳定,没有发生根本性的改变。