随着经济发展，人类对矿产的需求越来越大，对矿山的开发活动也越来越频繁，这就产生了大量的废石、废渣和酸性矿山废水，严重危害了生态系统，给人类健康带来重大威胁。在酸性矿山环境形成的过程中，铁的氧化与还原在其中扮演了一个重要角色。本论文以一株分离自安徽铜陵狮子山酸性矿山环境中的铁还原菌AMDY2-9-2为研究对象，对其还原Fe(Ⅲ)的特性进行研究，并利用iTRAQ技术对其在有铁和无铁环境下蛋白质组进行研究，为从蛋白水平揭示其还原铁提供理论依据，同时也有望为酸性矿山环境的治理和生物修复提供理论依据。　　对AMDY2-9-2再次进行16S rDNA测序，并与原始16S rDNA序列进行比对，结果表明表明AMDY2-9-2无变异发生。对AMDY2-9-2的培养基进行改良，首先将三价铁离子的来源从硫酸亚铁的自然氧化改良成硫酸铁，结果表明菌AMDY2-9-2能正常生长并还原铁离子;其次将菌接入无铁的培养基中，结果表明菌AMDY2-9-2同样能生长，这为其差异蛋白质组的分析提供了基础。对AMDY2-9-2在有铁和无铁培养基生长过程中的生长周期，pH、Eh、SO42-浓度变化等参数进行研究，表明菌AMDY2-9-2在有铁组从第2天进入对数生长期，第6天进入稳定期，第16天之后进入衰亡期;无铁组同样从第2天进入对数生长期，但持续时间更长，到第8天进入稳定期，第14天以后，进入衰亡期。有铁组的pH随着时间会先降低后稳定，无铁组的的pH基本保持不变;有铁组的Eh随着时间基本保持不变，无铁组的Eh则处于先不断降低，后稳定不变的趋势;有铁组和无铁组的硫酸根变化都是先升高后保持稳定，变化趋势一致。AMDY2-9-2还原溶液三价铁离子实验和与针铁矿中结构铁的实验结果表明，培养基中二价铁离子的浓度都有增加，说明菌AMDY2-9-2确实可以还原三价铁离子，但是AMDY2-9-2还原针铁矿中的三价铁离子的还原速率非常慢，是一个长时间的过程。AMDY2-9-2的扫描透射软X射线显微镜观察结果表明，菌体表面附着大量铁，且二价铁的量多于三价铁的量。　　利用iTRAQ技术联合LC-MS/MS技术对菌AMDY2-9-2蛋白质组的研究中分为实验组和对照组，实验组即AMDY2-9-2的培养基中有三价铁存在，对照组培养基中无三价铁存在，实验组和对照组均设三个平行。结果共检出1368个蛋白，差异蛋白170个，其中上调蛋白106个，下调64个。对差异蛋白进行GO分析结果发现与金属结合蛋白、铁离子结合蛋白、铁-硫结合蛋白上调非常明显，与氧化还原，电子传递有关的蛋白也上调显著，统计得出有这些功能的差异蛋白有33个，其中有的蛋白有多个分子功能;这33个差异蛋白中有19个蛋白有metal cluster binding的功能，有4个蛋白有iron ion binding的功能，有19个蛋白有iron-sulfur cluster binding的功能，有10个蛋白有4 iron，4 sulfur cluster binding的功能，有5个蛋白有oxidoreductase activity, acting on CH or CH2 groups的功能，有2个蛋白有formate dehydrogenase (NAD+) activity的功能，可初步将这些蛋白作为菌AMDY2-9-2还原铁功能的关键蛋白进行深入的研究。通过对差异蛋白进行GO和KEGG Pathway综合分析，发现亮氨酸的代谢是一个重要过程，可能与AMDY2-9-2还原铁的的功能有关，也可将这些蛋白作为潜在功能蛋白开展后续研究。