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本研究应用多性状动物模型BLUP和REML对北京养猪育种中心中育猪配套系四个专门化品系B08系(长白)、B06系(大白)、C03系(皮特兰)、C09系(圣特西)的主要生产和繁殖性状进行了遗传分析。本文所采用的数据为北京养猪育种中心所属猪场2000-2005年间繁殖和测定记录，其中繁殖记录为9,800条；生产记录为4,608条。运用多性状动物模型估计主要性状的遗传参数，同时分析了主要经济性状的遗传趋势。
本论文估计的四个繁殖性状为总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)、初生窝重(LBW)和21日龄窝重(LW21)，其中B08系的这四个性状遗传力的估计值分别为：0.094、0.092、0.094、0.111；B06系的估计值分别为0.132、0.136、0.167、0.130；C03系的估计值分别为0.121、0.140、0.171、0.124；C09系的估计值分别为0.103、0.110、0.126、0.113。
同时，母体遗传效应占TNB、NBA、LBW和LW21四个性状表型方差的比例的均值及其范围分别是：0.017(0.011～0.028)、0.012(0.011～0.013)、0.030(0.010～0.036)、0.026(0.015～0.045)；窝效应占TNB、NBA、LBW和LW21四个性状表型方差的比例的均值及其范围分别是：0.014(0.006～0.020)、0.015(0.005～0.023)、0.016(0.003～0.023)和0.010(0.000～0.035)。
估计的生产性状共有两个：达100kg体重日龄(AGE)、100kg体重背膘厚(BF)。B08系这两个性状的遗传力分别是：0.250、0.480；B06系是：0.349、0.462；C03系是：0.280、0.380；C09系的估计值为：0.310、0.450。AGE和BF窝效应c2估计值结果为B08系(0.260，0.292)、B06系(0.332，0.242)、C03系(0.332，0.383)、C09系(0.190，0.213)。
另外，本文估计了四个专门化品系TNB、NBA、LBW、LW21等四个繁殖性状之间的相关，其中TNB/NBA、TNB/LW21、NBA/LW21、LBW/LW21的遗传相关估计值在0.90以上，表型相关的变化范围为(0.31～0.95)。四个专门化品系BF/AGE的遗传相关估计值的均值和变化范围为：-0.245(-0.12～-0.37)；它们的表型相关分别为-0.13、-0.23、-0.24和-0.10。
繁殖性状的遗传趋势方向是有利的但程度很小，四个专门化品系TNB的遗传趋势为(0.079,0.111,0.096,0.041)。对于生产性状，AGE和BF的遗传趋势为(-1.44,-1.75,-0.065,-0.041)和(-0.02,-0.03,-0.026,-0.382)均为有利的。