底栖硅藻是河流生物监测的重要研究对象,已被广泛用于河流生态健康评估。但在我国,由于起步较晚,可用于不同地区硅藻生物监测的种类名录还很不完整,很多地区缺少相对完整种类名录,河流管理的相关管理部门难以开展基于硅藻的生物监测,迫切需要在本地区典型水系开展基础调查,编制底栖硅藻名录,积累面向水质和生态健康评估方面的基础资料。本文于2015年对广东省典型中小河流—流溪河水系进行了4次底栖硅藻采样调查,主要结论有:1、在流溪河流域设置了21个采样点,开展的4次全流域采样,共检出底栖硅藻55属250种,其中,中心纲7属18种,羽纹纲48属232种。曲丝藻属(Achnanthidium)、舟形藻属(Navicula)、菱形藻属(Nitzschia)和异极藻属(Gomphonema)是优势类群,出现频次和相对丰度较高。底栖硅藻多样性(丰富度和真香农多样性指数)呈上游和下游较低,中游较高的空间分布特征。底栖硅藻群落相异性在一级和三级河流较高,二级河流较低;群落结构空间变化明显,季节变化显著。2、冗余分析表明,由环境因子组成的模型能显著解释底栖硅藻群落的变异;方差分解结果表明与营养水平相关的环境因子集合的解释能力最强,说明营养水平是影响硅藻群落结构的最主要因素。3、每个底栖硅藻样品均设置400、600和800个的样品计数量,获取底栖硅藻群落数据。结果表明,样品计数量需增加到600个,才能保证大部分的种类被检出:样品计数量从400个增加到600个时,种类数增加15.2%,而600个增加到800个时为8.1%。4、硅藻生物指数能较好地反映采样点环境信息,适用于我省中小型水系水质与生态健康评价。