中系史宾格犬MC1R和TYRP1基因多态性及其与毛色相关性研究

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangmu2003
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
毛色是犬类重要的经济性状,在确定品种纯度和亲缘关系方面起着重要的作用。开展犬毛色基因的遗传学研究具有理论意义和经济价值。本研究以公安部南京警犬研究所繁育的中系史宾格犬为试验材料,选择MC1R、TYRP1基因为毛色主要候选基因,探讨MC1R和TYR1基因的多态性及其与犬毛色性状的关联性,为犬毛色性状遗传育种研究提供分子生物学依据。通过以上研究,获得以下主要研究结果:(1)中系史宾格犬MC1R基因完整CDS区全长954 bp,编码317个氨 基酸。该序列与犬、马、人等11种动物MC1R基因CDS区存在68.24%~100%的同源性,相应氨基酸序列的同源性达59.81%~100%,系统发育树表明,中系史宾格犬与拳师犬亲缘最近,与鸡的亲缘关系最远。表明MC1R基因在不同哺乳动物间具有较高的保守性,发挥相似的功能。(2)本试验主要采用DNA测序、PCR-RFLP、AS-PCR和PCR-SSCP技术分别对2种毛色的中系史宾格犬MC1R、TYRP1基因的CDS区进行了遗传多态检测。研究结果表明:在MC1R基因编码区出现3个SNP位点:A268G、G313A、C476A;其中在第268 bp处,发生A>G(AGC-GGC)的突变,并在该位点检测到2个等位基因,产生3种基因型:AA、AG、GG,该突变导致编码的氨基酸由丝氨酸(serine)突变为甘氨酸(glycine);在编码区第313 bp处,发生G>A(GCC-ACC)的突变,该突变导致编码的氨基酸由丙氨酸(alanine)突变为苏氨酸(threonine);编码区第476bp处,发生C>A(CCG-CAG)的突变,该突变导致编码的氨基酸由脯氨酸(proline)突变为谷氨酰胺(glutamine)。同样,在7TRP1基因编码区出现3个SNP位点:T121A、C991T、P345△,其中在TYRP1基因外显子2(以第2外显子为起始)第121bp处存在T>A的突变,该突变导致编码的氨基酸由半胱氨酸(cysteine)突变为丝氨酸(serine);在TYRP1基因外显子5第991 bp处存在C>T的突变,该突变导致编码的氨基酸由谷氨酰胺(glutamine)突变为终止子;外显子5第1033-1035 bp处存在3个碱基的缺失,该突变导致编码的氨基酸脯氨酸(proline)缺失。(3)对中系史宾格犬群体进行Hardy-Weinberg平衡检验,发现该群体在C476A、T121A和P345△突变位点上处于平衡状态(P>0.05),且T121A和P345△这两个位点的基因型频率分布完全一致。C991T基因型频率分布未达到H-W平衡(P<0.05),基因型在群体间的分布差异极显著(P<0.05)。对MC1R基因和TYRP1基因多态位点间连锁不平衡分析表明:MC1R基因3个SNP位点两两间连锁不平衡数|D’|都为1,γ2=1,表明MC1R基因3个SNP位点共同位于同一单倍域,为完全的连锁不平衡;TYRP1基因3个SNP位点两两间连锁不平衡数|D’|都为1,γ2>0.374,表明TYRP1基因3个SNP位点共同位于同一单倍域,存在强的连锁不平衡。(4)关联分析表明,未发现史宾格犬MC1R基因C476A突变位点与犬的毛色有显著的相关性(P>0.05)。7YRP1基因T121A和P345△多态位点与史宾格犬2种毛色极显著相关(P<0.01);C991T位点与史宾格犬2种毛色显著相关(P<0.05)。(5)通过phase 2.1软件对TYRP1基因的SNPs进行单倍型分析,共得到3种单倍型和6种单倍型组合,AC△单倍型为优势单倍型,关联分析表明AC△单倍型与犬的褐白花毛色极显著相关(P<0.01);H1、H2、H3单倍型组合决定褐白花色史宾格犬;H4、H5、H6单倍型组合都是黑白花色史宾格犬。(6)中系史宾格犬TYRP1家系分析表明黑白花对应于褐白花毛色是常染色体显性遗传,其单倍型遗传符合孟德尔分离定律,能稳定的遗传给后代。
其他文献
本研究以北京油鸡种公鸡为试验材料,以热休克蛋白70-2基因(HSP70-2)为候选基因,分析该基因5’侧翼区和编码区的遗传多态性与北京油鸡公鸡精液品质的相关性,并研究热应激对不
2009年是新中国成立60周年,是奥运成功举办之后首都发展进入新阶段的第一年,同时也是国内外环境发生深刻变化、宏观调控政策发生重大调整、确保经济平稳较快发展的关键一年。
本刊讯据农业农村部网站消息,4月1日,农业农村部召开2020年部系统计划财务工作视频会议,总结2019年计划财务工作,分析面临的形势和任务,部署2020年重点工作.农业农村部副部长
期刊
1942年新年刚过,中央警备团用喜庆欢快的锣鼓声,把一批参军的热血农民青年迎进了军营。部队注入了新的战斗血液,实是令人高兴,老兵新兵一起联欢,亲热地互相介绍各自的情况,连
针对忻州窑矿煤层坚硬(f=3~4.5),顶煤难冒落、难破碎的特点,在工作面中间巷通过施工深孔,用爆破的方法直接破碎顶煤,实现了坚硬煤层放项煤开采技术,取得了可喜的效果。 Accor
介绍了一种用于提升设备的新型防过卷装置,即用液压缓冲器代替目前用的契形罐道,并阐述了其工作原理及设计要点。 A new type of anti-roll-over device for lifting equipmen
为探索扬州地区湿润农田生态系统土壤剖面氮素的运移规律、小麦和多花黑麦草对氮素的吸收和利用及对作物的有效性,为优化施肥和种植制度,减少土壤硝态氮残留和向深层土壤运移提供理论依据。于2008-2009年在江苏省扬州市扬州大学试验牧场展开试验,在自然降雨和人工灌溉、常规灌溉和磷钾供应充足的条件下,以“杨麦13号”小麦和多花黑麦草“邦德”为试验材料,设置不同的施氮水平,分别表示为N0、N100、N200、
以乙酰丙酮和1,4-二(邻氨基苯氧基)丁烷进行缩合得到Schiff碱配体L,再与CdI2进行配位反应,得到了配合物[CdLI2]n(1),并用元素分析,FTIR和X-射线单晶衍射进行了表征。结果表明
村支书作为推进农村改革发展的领导者、组织者和执行者,使命神圣,责任重大。如何履行职责、担负使命,笔者认为,应做到以下几点。“学”为先。要不断学习理论,审时度势,抓住机
《中国企业家》2015年第22期封面故事《蚂蚁搬山》在余额宝风生水起的背后,感到割肉般疼痛的是传统银行。其主导社会资金供求模式和定价机制的地位被动摇,躺着赚大钱的日子渐