随着科学技术的不断发展，质谱技术广泛应用于分析化学和计量领域，其中以液相色谱-三重四极杆质谱(LC-MS/MS)为代表的液质联用技术，能够极大程度提升复杂样品分析能力，推动质谱技术在医用领域的快速发展，使得质谱技术在临床诊断和精准医学检测方面呈现巨大的应用潜力。
　　本研究从谱图数据浓度信息提取角度出发，通过分析LC-MS/MS数据结构性质，设计开发整套谱图信息提取定量检测方法，包括原始数据去噪、色谱解析与识别、谱峰匹配、曲线拟合等算法。设计一种依赖曲线信号与噪声自身数据特点的算法对原始谱图噪声进行自动去除，采用平滑Z-score法与多段斜率法相结合的算法对目标化合物质量色谱峰进行解析，实现对复杂基质样品中拖尾峰、肩峰和低浓度峰的准确识别，对待测谱峰进行保留时间校正，并对曲线拟合权重进行讨论，建立标准曲线完成定量检测。本文以当前临床检验流程较为完善的人体血清中25-羟基维生素D检测为例，验证自开发算法，形成一套LC-MS/MS多反应监测(MRM)扫描模式下的配套定量分析算法包，减少优化时间，提高谱图数据处理自动化水平。
　　针对临床复杂基质样本特别是内源性代谢物的检测，在通用谱图处理算法的基础上，以人血清中维生素检测为例，探讨一种针对人体内源性代谢物的分析方法。分别通过混合人血清基质加入标准品再扣除内源性物质本底的标样制备方法，以及牛血清白蛋白(BSA)模拟基质加标的方法建立标准曲线进行定量。结果表明，两种方法线性相关系数均在0.996以上，对实际样品的低、高两个浓度加标回收率为90%-112%。因此对于人体内源性代谢物采用混合人血清基质扣除本底的方法，可以实现标准样品与待测样品基质匹配的准确分析，有利于临床相关疾病的便捷诊断。
　　基于本文开发的通用定量数据处理分析算法，融合对人体复杂基质样本内源性代谢物检测分析方法，设计特定临床检测质谱仪专用操作软件，最终形成一套针对临床应用的LC-MS/MS软件处理系统，已应用于苏州医工所天津工研院医用三重四极杆质谱仪研制项目的产品化工程样机中。