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目的:评价国家自然科学基金(NSFC)的实施效果,通过对NSFC资助产出医药卫生类SCI论文的文献计量学分析,了解我国医药卫生研究的发展现状、研究成果和存在的问题,为学术交流发展提供指导。方法:以2010—2014年科学引文索引(SCI)的数据为依据,运用文献研究法、统计分析法和文献计量学方法对NSFC资助产出医药卫生类论文的核心期刊、高产作者、高产机构、高影响力论文、论文被引频次及零被引论文等问题进行全面、客观的定量研究。结果:2010—2014年,NSFC资助产出医药卫生类SCI论文为33829篇,逐年分别为137、2009、5999、11393和14291篇;NSFC重点资助的医药卫生领域集中在肿瘤学、药学、神经学和化学等方面。累计论文数位居前10位的地区为科技、经济、教育和文化水平相对发达、医学高等学府和医院较集中的地区,包括上海、北京、江苏、广东等省(市)。累计论文数位居前10位的机构包括上海交通大学、中山大学、中国科学院和南京医科大学等高校和科研院所。5年间,刊载NSFC资助产出医药卫生类SCI论文最多的期刊为Plos One(2902篇);总被引频次最多的期刊为Plos One(22044次)。2011—2014年,NSFC资助产出SCI论文的几何增长速度为16.98%,NSFC资助产出医药卫生类SCI论文的几何增长速度为63.31%,比同期NSFC资助产出SCI论文高46.33%。NSFC资助产出医药卫生类SCI论文影响因子的P50(P25~P75)逐年分布为2.77(1.86~3.71)、2.81(1.93~3.71)、2.91(1.99~3.72)和2.83(1.93~3.77)。2011—2014年NSFC资助产出医药卫生类SCI论文33692篇,其中零被引论文4116篇,占12.22%。从绝对数看,发表在影响因子为0~3的期刊的论文共有3299篇未被引用,占全部零被引论文的80.15%。结论:综上所述,获NSFC资助产出医药卫生类SCI论文的地区及机构分布过于集中,学科分布不均衡。获NSFC资助产出医药卫生类SCI论文增长速度和质量均有提高。获NSFC资助产出医药卫生类SCI零被引论文主要集中在影响因子较低的期刊上。建议:基金管理部门适当调整基金资助制度,鼓励各地区和机构,尤其是欠发达地区科研人员创新的积极性,促进我国各地区科研水平的均衡发展;基金管理部门适当扶持预防医学、中医学等弱势学科,全面提高我国科技创新水平;增加国内科技期刊在考评体系中的权重,更加重视中文期刊在我国科研评价体系中的作用;关注论文的被引频次,主要看他引次数;区别SCI期刊的影响因子的分值段。