高技术产业作为产业发展的中流祗柱,已成为体现各国国际竞争力及科技水平的重要标尺,在引导区域经济结构转型、支撑世界经济发展方面扮演着重要角色。近年来,我国政府开始高度重视高技术产业的技术创新,不断增加创新投入,提高创新产出。但鉴于我国目前高技术产业的创新资源有限,要提高整体的创新水平,主要是要提高技术创新效率。此外,考虑到我国各行业的高技术产业发展特点,各行业在高技术资源的投入和配置上存在一定的差异,因此,为了有效改善各行业技术创新效率需要准确测度各行业的技术创新效率,并有针对性的提出改善意见。本文首先回顾了国内外学者们关于高技术产业、技术创新和技术创新效率的相关理论以及高技术产业技术创新效率的实证研究。然后将创新活动分为研发和市场转化两个阶段,构建完善的投入产出指标体系,以《中国高技术产业统计年鉴》中数据为数据基础,采取定量分析的方法,通过动态网络DEA模型测算出我国五个高技术行业的整体效率、阶段效率(研发效率、市场转化效率)和各阶段投入产出指标的投影值。最后将动态网络DEA模型测算出的整体效率、阶段效率与传统DEA模型、网络DEA模型测算出的结果加以比较,分析动态网络DEA模型的适用性。结果表明:第一,从整体效率来看,我国各行业的技术创新效率不高,且各行业存在较大差距。第二,从阶段效率来看,相对于市场转化阶段来说研发阶段是我国高技术产业技术创新的较薄弱环节。第三,除计算机及办公设备行业外其他行业应根据投入产出投影进行效率改善。第四,动态网络DEA模型对效率及投影的测算更为准确,有更强的适用性。