不同生理阶段奶牛瘤胃细菌菌群数量与多样性的比较研究

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 19次 | 上传用户:com_wang
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本论文运用实时荧光定量(RT-PCR)技术,研究了不同生理阶段对荷斯坦奶牛瘤胃中总细菌、白色瘤胃球菌、黄色瘤胃球菌、产琥珀酸丝状杆菌、溶纤维丁酸弧菌、普雷沃氏菌、牛链球菌以及嗜淀粉瘤胃杆菌数量的影响;同时运用16S rRNA高通量测序技术探究了不同生理阶段奶牛瘤胃细菌多样性的变化规律,并与泌乳性能进行了相关分析;此外,还探究了生理阶段对奶牛瘤胃发酵参数和养分表观消化率的影响。本研究采用单因素随机试验设计,选取围产前期、泌乳前期、泌乳中期、泌乳后期和干奶期经产荷斯坦奶牛各4头。在奶牛晨饲后6h,采集瘤胃食糜,用于测定不同生理阶段奶牛瘤胃中8株细菌的数量、细菌多样性和瘤胃发酵参数;采集各生理阶段奶牛饲料样与粪样,用于测定不同生理阶段奶牛养分表观消化率。试验结果表明:(1)奶牛从围产前期进入泌乳期,黄色瘤胃球菌、产琥珀酸丝状杆菌和总细菌的数量显著降低(P<0.05),进入干奶期后,显著升高(P<0.05)随后恢复到与围产前期相似水平(P>0.05)。然而牛链球菌、普雷沃氏菌和嗜淀粉瘤胃球菌数量的变化趋势与之相反。白色瘤胃球菌和溶纤维丁酸弧菌数量在各个生理阶段无显著差异(P>0.05)。产琥珀酸丝状杆菌和总细菌数量在泌乳前期显著高于泌乳中期和泌乳后期(P<0.05),泌乳中期和泌乳后期无显著差异(P>0.05),嗜淀粉瘤胃杆菌数量的变化趋势与之相反,黄色瘤胃球菌、牛链球菌和普雷沃氏菌数量在泌乳期各阶段无显著差异(P>0.05)。(2)奶牛从围产前期进入泌乳期,瘤胃细菌多样性显著降低(P<0.05),进入干奶期后,显著升高(P<0.05),随后恢复到与围产前期相似水平(P>0.05)。瘤胃细菌多样性在泌乳前期显著高于泌乳中期和泌乳和后期(P<0.05),泌乳中期与泌乳后期无显著差异(P>0.05)。(3)奶牛在围产前期和干奶期瘤胃优势菌门为拟杆菌门和厚壁菌门,在泌乳期的优势菌门为拟杆菌门、变形菌门和厚壁菌门。科水平上,围产前期和干奶期瘤胃优势菌科为普雷沃氏菌科;泌乳期的优势菌科为琥珀酸弧菌科和普雷沃氏菌科。(4)奶牛从围产前期进入泌乳期瘤胃中拟杆菌门、SR1细菌、柔膜菌门、TM7细菌、纤维杆菌门、放线菌门、普雷沃氏菌科和瘤胃菌科的相对丰度显著降低(P<0.05),在泌乳期各阶段无显著差异(P>0.05),进入干奶期后显著升高(P<0.05),并恢复到与围产前期相似水平(P>0.05);而变形菌门和琥珀酸弧菌科相对丰度的变化趋势与之相反。厚壁菌门和毛螺菌科的相对丰度在各生理阶段无显著差异(P>0.05)。(5)通过PcoA分析发现奶牛在围产前期和干奶期瘤胃细菌组成相似,但与泌乳期差异较大;泌乳中期与泌乳后期瘤胃细菌组成相似,与泌乳前期差异较大。(6)奶牛瘤胃中月形单胞菌属相对丰度与乳脂率呈显著正相关(r=0.58,P<0.05),罗斯氏菌属相对丰度与乳糖率呈显著负相关(r=﹣0.59,P<0.05)。(7)奶牛瘤胃NH3-N浓度在各生理阶段无显著差异(P>0.05);奶牛从围产前期进入到泌乳期,瘤胃pH值、MCP浓度、乙酸浓度、异丁酸浓度、丁酸浓度、异戊酸浓度、TVFA浓度与乙酸/丙酸比例显著下降(P<0.05),进入干奶期后,显著升高(P<0.05),恢复到与围产前期相似水平(P>0.05);而丙酸浓度和戊酸浓度变化趋势与之相反。比较不同泌乳期时发现,奶牛瘤胃pH值和TVFA浓度再各泌乳期无显著差异(P>0.05);MCP浓度、异丁酸浓度和异戊酸浓度在泌乳前期显著高于泌乳中期和泌乳后期(P<0.05),泌乳中期和泌乳后期无显著差异(P>0.05);乙酸浓度和乙酸/丙酸比例在泌乳后期显著高于泌乳前期和泌乳中期(P<0.05),泌乳前期和泌乳中期无显著差异(P>0.05);丙酸浓度在泌乳中期显著高于泌乳后期(P<0.05),与泌乳前期无显著差异(P>0.05),泌乳前期与泌乳后期无显著差异(P>0.05);丁酸浓度在泌乳中期显著低于泌乳前期和泌乳后期(P<0.05),泌乳前期和泌乳后期无显著差异(P>0.05),戊酸浓度的变化趋势与丁酸浓度的变化趋势相反。(8)奶牛从围产前期进入泌乳期,OM和DM全消化道表观消化率显著升高(P<0.05),在泌乳期各阶段无显著变化(P>0.05),进入干奶期后,显著降低(P<0.05),恢复到与围产前期相似水平(P>0.05);NDF表观消化率的变化趋势与之相反;ADF表观消化率在泌乳中期显著低于围产前期和干奶期(P<0.05),与泌乳前期和泌乳后期无显著差异(P>0.05),且在围产前期、泌乳前期、泌乳后期和干奶期无显著差异(P>0.05)。
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