肝细胞肝癌超声造影定量分析与成纤维生长因子19表达相关性研究

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背景:肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是消化系统常见恶性肿瘤之一,其预后很差,目前国内外没有明确的评估预后的标准和指南,HCC预后风险的评估对个体化治疗方案制定尤为重要。成纤维生长因子19(Fibroblast growth factor 19,FGF19)是一肽类分子,在肿瘤的发生、发展起到重要的作用。超声造影具有良好的显示血流功能,结合超声造影定量分析得到TIC(Time-intensity curve),可以定量的反映病灶血管的血流分布情况,本研究的目的是通过探讨FGF19在HCC中的临床价值,并探讨超声造影定量分析术前评估HCC预后的价值。方法:1超声造影定量分析参数与FGF19的相关性。1.1回顾性归纳总结30例HCC病灶的超声造影,并进行定量分析,获取超声造影定量分析参数,包括IMAX(Maximum intensity)、mTT(Mean transit time)、TTP(Time to peak)、RT(Rise Time)、RS(Rising slope)。1.2使用组织芯片检测免疫组化,并收集本研究纳入的30例患者的术后标本,应用免疫组化检测HCC组织及正常肝组织中FGF19蛋白的表达水平。1.3卡方检验分析HCC组织及正常肝组织中FGF19蛋白的表达差异。Fisher确切概率法分析超声造影定量分析参数与FGF19蛋白表达规律的相关性。2生物信息学2.1从TCGA数据库下载FGF19基因表达谱及临床参数信息,2.2 TCGA数据库中FGF19的临床意义运用GEPIA比较HCC组和正常肝组织组mRNA FGF19的表达水平,人类蛋白质表达图谱网站对FGF19进行生存分析,生成生存曲线图;卡方检验检测FGF19表达规律与临床病理参数的相关性;FGF19表达水平的临界值取中位数。P<0.05为差异有统计学意义。2.3 FGF19相关基因的预测及基因富集分析、功能注释采用MEM网站检索FGF19的相关基因,并在DAVID数据库进行GO分析和KEGG富集通路分析。2.4基因突变水平检测及调控网络构建采用基因组学网站cBioPortal分析FGF19在HCC中突变和拷贝数的变化,并对FGF19相关基因构建调控网络。结果:FGF19蛋白在HCC组织与正常肝组织中的表达有显著差异(P<0.05),FGF19蛋白在HCC中呈高表达。FGF19阳性表达组与超声造影定量分析参数的RS、TTP、RT有关,差异有统计学意义(P<0.05),与IMAX、mTT无关。TCGA数据库统计结果表明,mRNA FGF19在HCC组织与正常肝组织中的表达无统计学意义(P>0.05),在HCC组织中mRNA FGF19的表达呈高表达的趋势,FGF19高表达与年龄、性别、肿瘤TNM分期及肿瘤细胞分级差异无统计学意义(P>0.05);FGF19高表达的HCC患者总生存时间较低表达的患者无统计学意义(P>0.05),但有FGF19高表达的肝细胞癌患者总生存时间短于低表达的患者的趋势。通过MEM网站得到的相关基因进行GO注释和KEGG富集分析,相关基因参与了DNA转录、磷脂酰肌醇-4,5,5乙磷酸激酶活性、高尔基复合体(P<0.02)。KEGG通路分析提示相关基因主要在癌症通路富集,通过基因组学网站分析FGF19相关基因在HCC中的变异情况,结果提12%的FGF19发生了基因变异,主要参与细胞的有丝分裂,与DNA甲基化呈负相关。通过构建调控网络,发现PTK2、PIP5K1A、SDC2的变异频数相对较高。结论:FGF19表达水平在HCC中呈高表达,可能通过相关靶基因参与HCC的发生、发展过程,提示FGF19是潜在不良预后危险因素;通过结合分析超声造影定量分析参数和FGF19的表达水平,了解HCC患者的预后,为HCC个体化治疗提供了依据。
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