登革病毒是一种能引起人类登革热，出血性登革热和登革休克综合征的黄病毒，其在世界范围内已造成了很大的危害，引起了全球的担忧和恐慌。　　登革病毒非结构蛋白NS3是一种多功能蛋白，其N端具有Ser蛋白酶活性， C端具有NTR磷酸酶及RNA解旋酶的活性，在病毒RNA的复制和病毒前体的加工过程中发挥着重要的作用。NS2B作为其辅助因子，通过与NS3形成异源二聚体复合物来激活其蛋白酶活性，并水解切割其他结构蛋白和非结构蛋白。若能抑制 NS3的活性，就能干扰病毒的复制和成熟，从而实现抗病毒的作用。因此，登革热病毒丝氨酸蛋白酶NS3已成为抗病毒药物的重要靶标。　　本研究以丝氨酸蛋白酶NS3作为分子靶标，从分子克隆构建重组质粒开始，利用大肠杆菌E.coli BL21（DE3）获得表达量较高的蛋白酶NS2B-NS3；并利用金属离子亲和层析，离子交换层析，分子排阻色谱等方法进行分离纯化，获得较高纯度的蛋白；而后采用荧光共振能量转移技术测定其活性，并建立了稳定的酶活体系（Z-因子=0.81）；最后采用高通量药物筛选技术对本实验室化合物库中200多种化合物和天然产物库中2000多种中药进行初步筛选，并对筛选出的抑制率大于80％的药物进行淬灭率检验和IC50测试，从而得到了17种对NS3蛋白酶抑制作用比较好的药物。其中两种药物的IC50值分别达到了39μM，66μM，这在目前已经报道的抑制剂中，其抑制作用还是非常显著的。