ANKRD29基因在非小细胞肺癌中的表达及其细胞功能的初步探索

来源 :广州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:juezhan2010
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景:肺癌在全球癌症病例中上升最快,死亡率占癌症死亡数的19.4%,其中约80%的病例为非小细胞肺癌(NSCLC)。全球肺癌患者的5年生存率低,约4-17%,随着对肺癌进展分子机制的更深认识,分子靶向治疗已成为晚期肺癌的重要治疗手段。目前肺癌治疗方面的研究聚焦于:抗体靶向的免疫治疗(如PD-1)和驱动基因(如EGFR、K-RAS、ALK、MET、HER-2等)的分子靶向治疗。有研究表明,编码锚蛋白重复序列(ANKRD)的基因(如肿瘤抑制基因p16和p18)发生突变,如基因缺失、甲基化和点突变,可能会导致肿瘤的发生。锚蛋白重复序列(ANKRD),是自然界中广泛存在的蛋白质模式序列之一,由30-34氨基酸残基组成,其功能是介导蛋白质之间的相互作用,并参与转录调控、促进或抑制细胞周期、细胞发育分化等过程。在前期研究中,我们通过基因芯片检测5个NSCLC患者的肿瘤组织和癌旁组织,发现ANKRD29在肿瘤组织中表达明显增高,提示其可能是一种新型肿瘤相关基因。研究目的本课题拟在前期研究基础上,验证NSCLC患者肺癌组织和癌旁组织中ANKRD29的表达差异,进一步探索其与患者临床病理、预后的相关性,并初步对其细胞功能探索,从而揭示ANKRD29在NSCLC起病中可能的作用机制。方法1.根据入排标准,选取2012年11月至2015年10月在我院行肺癌根治术的40例肺癌患者(肺癌组织作为实验组,其癌旁组织作为自身对照组),通过RT-PCR检测两组标本ANKRD29 m RNA的表达量差异,分析其与患者临床病理、预后的相关性。2.在7种肺癌细胞系中筛选出ANKRD29 m RNA表达量最高及最低的各2种细胞系作为细胞实验研究对象3.通过MTT、单克隆形成、细胞划痕迁移实验,初步观察4种肺癌细胞系活性、增殖、迁移的差异。4.统计学方法:连续性资料如果满足正态分布采用(?)±s进行描述,组间比较采用独立样本t检验,配对资料采用配对样本t检验;如果不满足正态分布则采用中位数±四分位数间距描述,组间比较采用Wilcoxon秩和检验,配对样本比较采用符号检验。分类资料采用频数和百分比描述,组间比较采用卡方检验。预后分析采用ROC曲线分析、Kaplan Meire生存曲线分析,组间比较采用Log-rank检验。多因素分析采用Logistic回归(结局为二分类资料)和Cox回归(结局为生存资料)。采用SAS9.4软件进行统计分析,P<0.05认为差异有统计学意义。结果1、NSCLC患者的流行病学特征此研究纳入40位NSCLC患者(共入组47例,其中7例因临床随访资料缺失而删除),年龄59.3±9.3;男性26(65.0%)人,女性14(35.0%)人;吸烟19(47.5%)人,不吸烟21(52.5%)人;腺癌26(65.0%)人,鳞癌14(35.0%)人;TNM分期Ⅰ期15(37.5%)人,Ⅱ期15(37.5%)人,Ⅲ期10(25%)人。2、NSCLC患者肺癌组织与癌旁组织中ANKRD29 m RNA的表达量差异ANKRD29在肿瘤组织【相对表达量中位数为2.42(0.85,6.42)×10-2】中与癌旁组织【相对表达量中位数为1.59(0.48,5.14)×10-2】中表达差异有统计学意义(P=0.029)。3、ANKRD29 m RNA的表达量差异与NSCLC患者临床特征及预后的关系分析【根据ANKRD29在C/NC组织中的相对表达将样品按照Fold Change中位数0.603分为2组:高(≥0.603,n=20)和低(<0.603,n=20)】1)ANKRD29与NSCLC患者临床病理特征的关系分析两组ANKRD29表达差异与性别(p=0.507)、年龄(p=0.778)、吸烟史(p=0.752)、组织学类型(p=0.507)、TNM分期(p=0.138)、淋巴结转移(p=0.116)均无统计学意义(P>0.05),其中高表达组TNM III期、淋巴结转移N2占比高于低表达组,P值偏小,有待进一步扩大样本量研究。2)ANKRD29与NSCLC患者预后的关系分析KM曲线分析发现ANKRD29的表达量差异与预后没有统计学意义(P>0.05),但低表达组预后有优于高表达组的趋势。Cox回归显示Fold change与复发相关性无统计学意义(HR=1.030(0.970,1.093),P=0.338),Fold change与转移相关性无统计学意义(HR=1.000(0.935,1.069),P=0.998),Fold change与存活相关性无统计学意义(HR=1.038(0.968,1.113),P=0.298)。4、7种肺癌细胞系中ANKRD29m RNA水平的表达差异(以GAPDH作为内参)对7种肺癌细胞系的RT-PCR结果显示ANKRD29 m RNA相对表达量由高到低顺序如下:H1975(0.000535±0.0000486370)、Hcc827(0.000428391±0.0000399682)、H1650(0.000334±0.0000513799)、pc9(0.000057±0.0000066776)、A549 ddp(0.000036±0.0000036970)、A549(0.000029±0.0000046298)、H1299(0.000024±0.0000010194)。Hcc827、H1650、H1975细胞系与其他相比差异均有统计学意义(P<0.0001)。挑选表达量较高的Hcc827、H1975和较低的H1299、A549细胞系作为下一步实验对象。5、ANKRD29与4种肺癌细胞系细胞功能的相关性分析1)ANKRD29与4种肺癌细胞系迁移的相关性24小时,四种细胞之间两两比较差异具有统计学差异(P=0.001);48小时,四种细胞之间差异具有统计学差异(P=0.0014);72小时,四种细胞之间差异具有统计学差异(P=0.0005);96小时,四种细胞之间差异具有统计学差异(P=0.001)。2)ANKRD29与4种肺癌细胞系活性的相关性四种肺癌细胞系活性在0-5天并未表现明显差异。H1975与Hcc8细胞增殖差异无统计学意义(P=0.2194);H1975与A549细胞增殖差异无统计学意义(P=0.4936);H1975与H1299细胞增殖差异无统计学意义(P=0.2928);Hcc827与A549细胞增殖差异无统计学意义(P=0.2051);Hcc827与H1299细胞增殖差异无统计学意义(P=0.3955);H1299与A549细胞增殖差异无统计学意义(P=0.2804)。3)ANKRD29与4种肺癌细胞系增殖的相关性Hcc8与A549、H1975、H1299相比,增殖差异有明显统计学意义(P=0.0063);H1299、Hcc827、A549细胞两两比较,增殖差异无明显统计学意义(P=0.495)。结论1、NSCLC患者中ANKRD29 m RNA在肺癌组织中的表达量显著高于癌旁组织。2、ANKRD29在肺癌组织中的表达差异与性别、年龄、吸烟史、组织学类型、TNM分期、淋巴结转移未见明显相关性。3、高表达组淋巴结转移N2、TNM III期占比高于低表达组,P值偏小。4、ANKRD29 m RNA低表达组预后有优于高表达组的趋势。5、本研究提示ANKRD29可能是NSCLC的促癌基因之一,可能与肺癌细胞的迁移能力有相关性,还有待后续实验继续探索。
其他文献
文章利用特定事件提供的自然实验机会,分析了不确定性冲击对企业投资行为的影响及机制。文章以上市公司2013-2016年季度数据建立双重差分模型证实,在供给侧结构性改革政策实
温胆汤具有燥湿化痰,清热除烦之功,笔者常以温胆汤化裁治疗2型糖尿病、失眠、糜烂性胃炎、慢性肾功能不全氮质血症期等属湿浊内蕴者。
目的研究慢性多重应激大鼠心房肌L-型钙通道α1c亚单位表达变化及L-型钙通道阻滞剂维拉帕米的拮抗作用。方法建立大鼠慢性多重应激心律失常模型,以维拉帕米作为干预,试验结束
依法保障犯罪嫌疑人、被告人诉讼权利实现的思考王凤岐通观国际社会的刑事立法,无不以对自然人的无罪推定作为重要原则,从而确立不得对任何人进行任意逮捕、拘禁或放逐,并有权在
新疆兵团在上世纪90年代中期总结归纳出"农业十大主体技术体系",并进行了大面积推广应用,使兵团农业的科技含量和经济效益在短期内获得显著提高.随着"农业十大主体技术体系"
目的探讨急性冠状动脉综合征合并高出血风险患者行经皮冠状动脉介入治疗(PCI)术中应用比伐卢定的治疗效果及安全性。方法选取108例急性冠状动脉综合征合并高出血风险并且接受
随着激光技术的发展,激光在大气中的应用正受到世界各国的广泛重视,如激光雷达、大气激光通信、激光能量传输和激光测距等。当激光在大气中长距离传播时,由于大气的影响,相干
"肺与大肠相表里"出自《黄帝内经》,意为肺与大肠互为表里,在经络上相互联系,在生理和病理上相互影响。目前研究表明肠道和呼吸道菌群可相互影响,肠道和呼吸道黏膜免疫系统在
水性导电油墨是一种既具有水性油墨特性又具有导电性能的新型功能性油墨。在水性油墨配方中,添加具有导电性能的材料作为填料,从而使其具有一定导电性的功能性油墨,广泛应用于薄膜开关、加热元件、太阳能电池、集成电路等工业领域。石墨烯是由碳原子sp2杂化形成类蜂窝状的二维晶体,其每个碳原子都与邻近的3个碳原子相连,形成σ键,这些C-C键赋予石墨烯优异的力学性能;每个碳原子都贡献一个未成键的π电子,它们可以在石
文章运用自编量表对6所高职院校325名专任教师的职业适应状况进行调查发现,高职院校教师职业适应包括学校工作适应、职业环境适应、社会服务适应、人际关系适应四个维度。教师