长链非编码RNA HAGLROS在三阴性乳腺癌中的作用机制初探

来源 :昆明理工大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:slhulala
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三阴性乳腺癌(TNBC)其特点是不表达ER、PR和HER2。TNBC具有高度侵袭性,临床预后较差。LncRNAs在TNBC进程中具有重要的作用,深入研究lncRNAs的生物学特性以及在侵袭转移中的作用有望为三阴性乳腺癌的早期诊断和预后监控提供新的靶标。我们通过在TCGA数据库中下载乳腺癌的测序数据与临床信息,挑选出三阴性乳腺癌和癌旁数据,进行差异表达分析,cox生存分析。结果显示有175个基因(包含40个lncRNA)的表达水平与三阴性乳腺癌患者生存相关,其中lncRNA HAGLROS基因的HR值最高(HR=4.75,95CI%1.59-14.24,p=0.005)。生物学实验结果表明HAGLROS在三阴性乳腺癌细胞中高表达,敲低HAGLROS可显著抑制MDA-MB-231细胞(三阴性乳腺癌)的增殖及迁移能力,提示HAGLROS在三阴性乳腺癌发生发展中发挥重要的生物学功能。通过共表达和lncRNA、mi RNA的在线数据库进行生物信学分析,我们预测HAGLROS可能调控8个m RNA基因(LRRC8D、HOXD13、TMPRSS4、HRAS、HOXD8、LRP4、HOXD9、TFF3);另外,HAGLROS可能通过靶向7个mi RNA(hsa-mi R-326、hsa-mi R-330-5p、hsa-mi R-1297、hsa-mi R-4750、hsa-mi R-6727、hsami R-6749、hsa-mi R-6799)调控23个m RNA基因(PKNOX2、SIDT1、PRDM16、HOXD13、NGFR、TMEM179、DMBX1、KLHDC7A、KCNQ4、ADAMTS15、KCNJ12、ATP2B3、PAX5、DCLK1、CNR1、MYT1、MAN1C1、RXRG、FOS、SLC20A1、CNTNAP2、SALL3、SCN9A),KEGG分析发现靶m RNA主要参与5条信号通路。根据预测的ce RNA网络(1个lncRNA,7个mi RNA,30个m RNA),开展初步功能验证,结果显示敲低HAGLROS后hsa-mi R-6799-3p、hsa-mi R-330-5p表达量上调,而过表达HAGLROS后hsa-mi R-4750-5p、hsa-mi R-6749-5p、hsa-mi R-6799-3p、hsa-mi R-330-3p表达量下调,提示HAGLROS可能通过海绵作用吸附hsa-mi R-6799-3p进而影响三阴性乳腺癌细胞的增殖和转移。综上,我们利用TCGA数据库揭示了HAGLROS与三阴性乳腺癌预后强相关,HAGLROS可能通过海绵作用吸附hsa-mi R-6799-3p进而影响三阴性乳腺癌细胞的增殖、转移,这为三阴性乳腺癌的治疗提供了新思路。
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