中国加入WTO将推动农业参与全球化竞争，在为中国农业发展提供更多机遇的同时也将使中国农业面临巨大的挑战和风险，这种挑战和风险除了来自于农业本身的发展水平和能力外，政府的农业制度安排及政策措施的执行状况也扮演着十分重要的角色。合理有效的制度安排是降低交易费用的关键，也是提高农产品国际竞争力的重要因素。因此依据中国农业补贴的具体情况及美日欧农业补贴的现状，在WTO农业协议规则允许下，利用存在的补贴空间，对农业补贴政策做出合理的调整具有极大的现实意义。本文对我国农业补贴问题进行了探讨，首先以制度经济学的相关理论为基础，运用博弈论的基本研究方法对农业补贴制度的产生和变迁进行了一般性分析，这也为各国农业补贴制度的演进奠定了理论基础；其次，比较分析了中外农业补贴制度的产生背景，在不同的政治经济背景下产生了不同的农业补贴制度；再次，对中外农业补贴的强度及各国执行农业协议承诺的情况进行了比较分析，由此找出了中国农业补贴体系所存在的问题；最后，根据我国在农业协议规定下所存在的农业补贴空间，对现阶段我国农业补贴进行了政策选择，即建立以直接补贴为主的农业补贴体系，它的政策目标是增加农民收入，保持农村稳定，保证粮食安全及加入WTO后农业的可持续发展。