大力发展农产品加工业,推动农产品加工业转型升级是深化农业供给侧结构性改革的重要内容,是实现以产业兴旺助力乡村振兴的战略高地。新疆的特色灌溉农业、绿洲农业,成为新疆农产品加工业发展的基础,而农产品加工业的发展对带动就业、完成脱贫攻坚任务实现全面小康、助力新疆经济高质量发展具有重要意义。然而,囿于多种原因的限制,新疆农产品加工业始终处于加工链条短、产品附加值低的状态。因此,推动农产品加工业深加工,促进农产品加工业转型升级成为“十三五”期间新疆自治区政府的重点扶持和优先发展对象。基于相关文献资料,结合理论分析与实际考察、规范分析与实证分析的方法,本文围绕新疆农产品加工业转型升级路径展开研究。首先,明确本文研究对象为新疆12个农产品加工业细分行业后,分析了新疆农产品加工业转型升级的基础。从生产增值能力、加工转化能力和盈利能力分析新疆农产品加工业转型升级的内在力量,从原料供给规模、市场需求规模和政策支持力度三方面分析新疆农产品加工业转型升级的外部条件;其次,研究了新疆农产品加工业转型升级状况。在描述新疆农产品加工业产业组织模式、地理分布和产业规模的发展基础上,从科技创新、低能耗生产、品牌建设三方面整体上剖析新疆农产品加工转型升级现状,并运用H-O模型从要素禀赋变化的角度实证检验了新疆农产品加工业各细分行业的转型升级阶段;之后,对不同阶段农产品加工业选取典型行业,构建SBM超效率静态模型和ML指数动态模型测评各阶段的转型升级效率;再次,分析不同阶段下制约新疆农产品加工业转型升级因素;最后针对不同阶段的新疆农产品加工业转型升级设计路径,并提出相应保障措施,以实现新疆农产品加工业的价值链攀升。通过以上考察和分析,研究结论如下:(1)新疆农产品加工业遵循由劳动密集型向资本密集型的转型升级路径:纺织服装鞋帽制造业处于劳动密集型阶段,大部分行业处于由劳动密集型向资本密集型过渡阶段,农副产品加工业、食品制造业等几个行业步入资本密集型阶段。(2)运用超效率SBM模型对不同转型升级阶段的重要行业进行效率测度,发现农产品加工业在各转型升级阶段目前主要存在规模小、技术投入不足、设备更新速度缓慢、生产要素利用能力较弱等问题。具体而言:静态效率结果表明新疆农产品加工业的转型升级效率总体较低,且行业资源利用能力与行业所处转型升级阶段并无正相关关系。所有行业中,食品制造业的静态效率值最低,纺织业、造纸及纸制品制造业的技术研发投入低,环境污染较为严重;含ML指数的动态效率测度结果表明,2010年是农产品加工业全要素生产率变化(ML指数)的分异节点:新疆农产品加工业ML指数整体上在2010年之后的波动幅度较大,技术进步和技术效率变化交替成为ML指数变化的主要原因。处于劳动密集型阶段的行业,全要素生产率呈先上升后下降趋势。处于由劳动密集型向资本密集型过渡阶段的行业中,纺织业的全要素生产率最低。处于资本密集型阶段的行业,全要素生产率变化波动明显。(3)通过分析制约新疆农产品加工业的外部因素,发现金融支持、集聚程度、财税支持政策是影响新疆农产品加工业转型升级的主要因素。