猪PRV感染PK15差异表达miRNAs的功能探索及3个免疫相关基因的分子特征研究

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各种病原引起的传染性疾病给现代养猪生产造成了巨大损失,本研究应用在猪生产中传染性强、死亡率高、危害大的伪狂犬病毒为模型,利用microRNA芯片技术,筛选与伪狂犬病毒感染相关的miRNAs,并探索其对病毒复制的影响及对宿主基因的调控作用,期望鉴定新的抗病候选miRNA和基因,为抗病育种工作提供有力的素材。获得了如下的研究结果:1.用伪狂犬病毒(PRV)感染PK15细胞并进行microRNA芯片杂交,筛选得到持续上调表达的miR-21,并通过QPCR得到验证;利用生物信息学预测及stem-loop RT-PCR方法克隆了miR-21。通过绝对定量PCR和免疫荧光检测发现过表达猪miR-21的PK15细胞中PRV病毒在核酸水平和蛋白水平均显著高于对照组。2.以小鼠肝癌细胞Hepal-6为模型,通过双荧光素酶报告基因实验结合ELISA方法验证了IP10是miR-21的靶基因.PolyI:C刺激小鼠巨噬细胞后,IP10基因mRNA先上调表达,4h后迅速下调,而miR-21表达水平持续上调,推测miR-21可能对IP10基因的mRNA水平存在负调控作用。对猪IP10基因进行了克隆,检测了其在成年通城猪各组织中的表达情况,结果表明猪IP10基因在脾脏中高表达。3.利用PCR-RFLP方法鉴定了猪IP10基因3’UTR存在C/T突变的SNP位点,与免疫性状关联分析结果表明该SNP位点与20日龄淋巴细胞百分数(LY%),80日龄红细胞压积(HCT)、平均红细胞容积(MCV)、红细胞平均血红蛋白含量(MCH)及80日龄血红蛋白含量(HGB)存在显著相关。4.通过比较基因组学和RT-PCR的方法克隆了猪3个免疫相关基因BCL10、PBD-108和STAT6的完整编码区(CDS);分析了其基因结构,BCL10有3个外显子2个内含子,PBD-108有1个外显子,STAT6含22个外显子和21个内含子。5.利用猪仓鼠辐射杂种板将猪BCL10基因定位于4号染色体,与微卫星标记S0161紧密连锁;猪STAT6基因定位于5号染色体,与微卫星标记DK紧密连锁。利用分别构建的BCL10,STAT6-pEGFP-N1融合表达载体转染细胞,发现猪BCL10在PK15细胞质中呈弥散广泛表达;STAT6在PIEC细胞整个细胞中呈广泛表达。6.用RT-PCR方法检测猪BCL10和STAT6在成年大白猪脑、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉、胃、小肠、脂肪和淋巴结各组织中的表达情况,结果表明BCL10,STAT6基因在检测的组织中广泛表达,BCL10在脾脏中表达量最高,其次为淋巴结、肾脏、肺脏和肌肉;STAT6基因在小肠中表达量最高,其次为肝脏、脾脏、肺脏和肾脏。7.通过PCR-RFLP方法检测到BCL10、PBD-108和STAT6的3’UTR均存在SNP。在国内外不同猪品种中进行基因频率分析,发现BCL10的T/C突变、PBD-108的A/T突变和STAT6的A/G突变,其等位基因频率在国内外猪种中存在显著差异。性状关联分析结果表明,BCL10基因SNP位点与0目龄平均红细胞体积、中间白细胞百分数、中间白细胞绝对值及17日龄红细胞总数存在显著相关(p<0.05),与32日龄红细胞数和血红蛋白含量存在极显著相关(p<0.01);PBD-108基因SNP位点与17日龄平均血红蛋白浓度极显著相关(p<0.01)。
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