随着经济的迅猛发展，生态环境的日益恶劣使人们开始反省经济发展模式，生态环境保护得到一定的重视，但是，环境利益及其相关经济利益在保护者、破坏者、受益者和受害者之间缺乏公平分配，导致了受益者无偿占有环境利益，保护者、受害者得不到应有的经济回报，破坏者未能承担应有的责任，因此，为了解决这种环境利益与经济利益扭曲的关系，我国应大力发展生态补偿。而由于生态环境所具有的公共物品属性，生态补偿应由政府主导。本文首先阐述了政府主导生态补偿的理论基础与选题意义，结合公共产品理论、外部性理论等分析了政府主导生态补偿的必要性及其特点，重点研究了陕西秦岭国家生态功能保护区和浙江省综合性生态补偿两个案例，提出了关于我国政府主导生态补偿实施过程中所存在的一些问题与缺陷，并分析了问题所在的原因。最后，从政府主导的角度，提出了我国生态补偿发展路径，建立专门的生态补偿机构与统一的管理体制；完善财政转移支付手段；成立生态有偿服务专项基金；构建生态补偿法律体系，拓展我国关于生态补偿的税收政策、明确政府在生态补偿中的行政责任等等。本文研究的突破点是分析了我国生态补偿以政府为主导的必要性及其他点，重点是构建我国政府主导的生态补偿制度路径，并提出了一对一的市场补偿作为政府主导生态补偿的辅助工具。