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河南信阳大别山区是黄缘闭壳龟最重要的分布区之一,但是由于生境破坏、环境污染和滥杀滥捕等原因,黄缘闭壳龟的野生资源量急剧下降,目前已被IUCN及CITES列为珍稀濒危物种,濒危等级EN。为了给黄缘闭壳龟提供在分子水平上的理论依据,本研究对黄缘闭壳龟进行了微卫星标记、单核苷酸多态性标记的开发,对黄缘闭壳龟卵壳膜与粪便进行了非损伤DNA试提取,并利用微卫星标记和线粒体标记技术对黄缘闭壳龟的群体进行研究。通过对黄缘闭壳龟群体的遗传多样性和遗传结构进行分析,测定群体间的遗传差异,预测杂种优势,为种质资源库的构建提供理论基础,同时也为大别山黄缘闭壳龟野生资源的保护和人工养殖的开展提供建议。本文研究的主要结果有:1.本研究采用FIASCO法,构建了黄缘闭壳龟富集文库,成功分离设计得到136对微卫星引物,并对微卫星位点进行评价,共检测出44对多态性微卫星引物。2.尝试采用磁珠富集的方法对濒危保护动物黄缘闭壳龟基因组中潜在的SNP位点进行了开发,共获得10条确认SNP位点的引物序列。3.以幼龟孵化后残留的卵壳和新鲜的粪便为研究材料,采用非损伤性方法对黄缘闭壳龟基因组DNA进行提取,证实了从粪便中提取DNA是不可行的,而从卵壳膜中提取DNA是可行的,能为后续黄缘闭壳龟的分子遗传提供研究材料。4.利用新开发的微卫星标记对3个不同来源的43只黄缘闭壳龟群体的遗传结构进行分析,发现养殖场中部分个体出现了不同亚群之间的基因交流现象,并将救护中心类群和师院类群合并为一个亚群,养殖场的两个类群分别作为一个亚群。5.利用线粒体基因CO1和CO2对来3个不同来源的黄缘闭壳龟群体(21只)进行了单倍型和系统发育分析,结合微卫星标记分析结果,把所有个体分为信阳地区种群,安徽地区种群和未知地区种群三个不同的种群,并推测未知地区种群可能为大别山以外地区的种群且与其他个体存在较远的进化关系,而信阳地区种群和安徽地区种群之间的进化关系更近。