2017年云南西双版纳地区登革热流行株的分子特征分析

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chang_baoping
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[目的]目前,已有100多个国家报道登革热的流行,登革热已成为世界的公共卫生问题。自2008年以来,云南不间断的出现登革热的流行。2017年云南西双版纳爆发了一场由DENV-1引起的登革热流行,确诊患者病例数1348例。本研究对2017年云南西双版纳地区登革热流行株的分子特征进行分析,旨在找出病毒株的进化与登革热流行的关系。[方法]本研究首先对云南2010年到2017年的登革热感染病例数进行统计分析。随后我们从2017年西双版纳傣族自治州的登革热患者中,随机挑取200份样品的血清,提取核酸,进行鉴定,并分别扩增登革病毒的NS1基因和全长,然后进行鉴定、测序、进化发育及突变分析。[结果]2010年至2017年,全省累计感染病例数达6524例,其中西双版纳傣族自治州、德宏傣族景颇族自治州、临沧市的感染病例数位居前三。2017年的200份登革热患者的血清经鉴定,均为DENV-1感染。扩增获得的2017年云南省登革Ⅰ型病毒分离株NS1基因,与2011-中国广东(JQ048541)有较近亲缘关系,且16株病毒的NS1基因之间较保守。在全基因的扩增及检测中,共获得5株DENV-1的全基因序列,长10735bp.进化树结果显示尽管五株病毒株都属于DENV-1中的基因亚型Ⅰ,但版纳株和缅甸株却在不同的分枝上。三株版纳株与2011-中国广东株有较近亲缘关系,两株缅甸株与2008-老挝株有很近的亲缘关系。此外,我们还发现有24个氨基酸的突变在进化树的分枝中扮演着重要作用。将三株版纳株与DENV-1标准株(Hawaii,1944,NO.EU848545)进行比对,共有658个碱基突变,产生87个有义突变。2017年的版纳株与缅甸株比对后,在编码区发现有52个氨基酸突变。两株缅甸分离株比对后,找到17个氨基酸的突变,且都发生在非结构蛋白区。此外,我们将版纳株与标准株进行蛋白质和RNA二级结构预测,蛋白二级结构预测显示共有46个结构变化,3’ UTR二级结构预测显示,与标准株相比,版纳株有2处明显的变化。[结论]2017年云南西双版纳登革1型毒株可能起源于东南亚、缅甸株可能起源于老挝。氨基酸分析发现24个氨基酸的替代在进化树的分枝中扮演着重要作用,可能是引起登革热流行的关键位点。此外,版纳株E蛋白区域的氨基酸替代可能增强了毒株的毒力。
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