细菌对氨基糖苷类药物耐药基因四重PCR检测试剂盒研制与应用

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:DNGOUSIYMMY
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究选择4个氨基糖苷类药物耐药基因(aph(3′)-Ⅱa、aac(6′)-Ⅰb、ant(3″)-Ⅰa、aac(3)-Ⅱa)作为扩增目的基因,根据多重PCR引物设计原则,设计了4对特异性四重PCR引物,应用单基因PCR扩增技术筛选出各个耐药基因的阳性菌株,并进行序列测定。测序结果与GenBank中的相应耐药基因序列比较,同源性依次为aph(3′)-Ⅱa(99.4%)、aac(6′)-Ⅰb(99.3%)、ant(3″)-Ⅰa(99.2%)、aac(3)-Ⅱa(95.3%),证明了设计引物的正确性和特异性。阳性菌株(E99,107)做为本方法阳性对照。在确定了4个单基因PCR扩增体系各个参数的最佳值和可变动范围的基础上,进行了4重PCR扩增体系的探索与优化,其中包括Mg2+浓度、dNTPs浓度、Taq酶浓度、引物浓度等组份浓度的优化,退火温度、循环次数等循环参数的优化。试验结果显示,成功建立了氨基糖苷类药物耐药基因的4重PCR检测方法,最佳反应体系如下:10×PCR Buffer 5μl,MgCl2(25 mmol/L)5μl,dNTP(2.5 mmol/L)4μl,模板5μl(菌液浓度相当于McFarland No 1.0),Taq DNA聚合酶(2.5 U/μl)0.3μl,上下游引物(25 mmol/L)各添加:aph(3′)-Ⅱa(0.5μl)、aac(3)-Ⅱa(0.9μl)、aac(6′)-Ⅰb(0.8μl)、ant(3″)-Ⅰa(1.8μl),最后补充灭菌双蒸水至50μl。最佳扩增反应参数为:94℃预变性5 min,94℃变性50 s,54℃退火45 s,72℃延伸50 s,共32个循环;最后72℃延伸10 min。4℃保存。本研究还对PCR模板制备方法进行了筛选和优化,通过添加60%甘油,保证了模板和Taq酶的稳定性。采用的待检细菌模板制备方法不需经过繁琐的细菌DNA提取过程,只需对细菌培养物进行两次离心即可进行测定。对试剂盒特异性、敏感性、重复性和保质期进行了系统的检测试验。检测结果表明:本试剂盒具有很强的特异性,只能特异性扩增出待检测的耐药基因;具有很高的灵敏度(3.6×104 CFU/mL);并且性能稳定,有很好的批内和批间重复性(100%);试剂盒在-20℃下的保质期为4个月。应用本检测试剂盒和传统药敏试验方法(K—B法)对30株细菌的耐药性进行检测,比较两者检测过程和检测结果。结果表明,两者检出结果的符合率为90%,本试剂盒还具有灵敏度高、操作简便,检测时间短等特点。应用该试剂盒对我国24个省45个规模化养殖场484株分离菌和四川地区30只大熊猫59株肠道分离菌进行了检测。结果表明:各个省市的分离菌检出率存在很大的差异。其中,aph(3′)-Ⅱa基因的最高检出率为80%(北京);aac(6′)-Ⅰb基因的最高检出率为26.7%(浙江);ant(3″)-Ⅰa基因的最高检出率为73.3%(山东);aac(3)-Ⅱa基因的最高检出率为66.7%(甘肃)。4个耐药基因的平均检出率分别为:aph(3′)-Ⅱa(46.1%)、aac(6′)-Ⅰb(11.6%)、ant(3″)-Ⅰa(50.4%)、aac(3)-Ⅱa(42.8%)。在59株大熊猫分离菌中,aph(3′)-Ⅱa的检出率最高(10.17%),其次为ant(3″)-Ⅰa基因(5.08%)和aac(3)-Ⅱa基因为(1.69%),而没有扩增出aac(6′)-Ⅰb基因。本研究率先在国内外建立了氨基糖苷类药物耐药基因四重PCR检测试剂盒,并应用该试剂盒对543株细菌进行了耐药基因的检测,为氨基糖苷类耐药基因的检测提供了一种快速、便捷、准确的方法。
其他文献
对集团企业通过信息系统管理研发项目的立项模式和监控手段进行研究,列举不同管理模式的优缺点,提出了基于Teamcenter系统的三种立项模式,帮助集团企业管理产品协同研发项目。
采用同时蒸馏萃取-气相色谱/质谱法对11种卷烟样品的挥发性成分进行了分析,并采用SPSS软件按欧式距离类平均法对90个成分峰进行了聚类分析。结果表明:11种卷烟样品可以聚为6个类
移位是句法生成的主要手段,是人类语言中普遍存在的一种现象,英汉两种语言中也不例外。因此,两种语言中移位的句式都存在很多相似的结构和特点。本文结合乔姆斯基的转换生成语法
在当今素质教育的大环境中,提高学生的语文水平的主要方法是培养阅读能力。在阅读能力的三要素(理解、记忆、速度)中,速度是最容易被忽视的,而速读能力恰恰是至关重要的,它是理解能
目的:探讨高频彩色多普勒超声对乳腺导管内乳头状瘤的诊断价值。方法:回顾性分析54例经手术和病理学证实的乳腺导管内乳头状瘤的声像特征和彩色多普勒频谱表现。结果:54例乳腺导
通过水化热试验、绝热温升试验和热养试验研究粉煤灰、矿渣的温度敏感性。研究表明,矿粉在高温环境下的活性明显大于粉煤灰,粉煤灰对降低胶凝材料的水化放热速率十分有效,大体积
目的监测感染伤口换药后操作者手污染情况,寻找有效的手卫生方法。方法对98例患者的感染伤口换药后,监测换药人员未洗手、常规洗手、六步洗手法洗手后手部病原菌,比较两种手卫生
目的:建立土荆皮药材中土荆皮乙酸的含量测定方法.方法:用甲醇提取,采用Merck-C18色谱柱(4.6mm×250 mm,4μm),甲醇-0.1%H3PO4水(65:35)为流动相,检测波长为256 nm.结果:土荆皮乙