在全球化的浪潮下,国际非政府组织得到空前发展。二十世纪以来,境外基金会逐渐活跃在中国的历史舞台中,境外基金会以及其它在华境外非政府组织引起了国内外学者的广泛关注。但是目前关于我国政府对境外基金会的管理制度研究相对较少,比较分散,不成系统。因此本文在辨证的借鉴国内外对国际NG0、境外在华NGO、基金会和境外基金会的研究成果的基础上,深入分析我国政府对境外基金会的管理制度的现状、问题,并尝试提出几点针对性的对策,为丰富我国关于境外基金会的研究以及探索更为有效的境外基金会管理制度略尽绵薄之力。本文主要运用文献分析法、比较分析法、案例分析法等,厘清理论之间的脉络,通过运用志愿失灵理论、全球治理理论和资源禀赋理论和新制度主义理论,从法律体系、登记制度、财税制度和监督制度四大方面对我国政府对在华境外基金会的管理制度的现状进行了详尽的分析,并在此基础上分析了我国政府对在华境外基金会管理制度中存在的法律体系不健全、登记注册门槛高、财税政策不完善和日常监督碎片化等问题,并进行了针对性的原因分析。在充分借鉴美国、俄罗斯和越南等国的先进经验下,为完善我国政府对在华境外基金会的管理制度提出了针对性的建议,包括健全管理在华境外基金会的法律法规体系、探索合理的在华境外基金会准入登记制度、完善在华境外基金会的财务以及税收制度、建立严密有效的在华境外基金会监督制度四大个方面,并对此进行一一具体论述。