这些年来,随着全球一体化进程的加快,国内外企业之间展开了激烈的竞争,创新成为了每个国家、每个企业的重要问题,并且党的十八大报告再次明确提出,实施创新驱动发展战略、抢占科技发展战略制高点,这已成为新时期转变中国经济发展方式的重要战略导向。合作创新作为一种技术创新模式,它于二十世纪八十年代后已帮助全球企业获得了前所未有的发展,它不仅帮助企业节约成本,降低研发风险等,而且还能从合作过程中获得资本、技术、人才、信息等有效资源,在一定程度上可以提高企业的创新成功率,对于目前我国经济进入新常态阶段来说,我们应该追求的是经济质量而不是数量,而合作创新为企业持久发展,顺利转型升级提供了一种很好的发展模式。本文首先对合作创新概念进行界定,再然后从成本与风险、知识与技术、信息三个方面来阐述合作创新影响企业创新绩效的机理。并以109家微观企业为研究对象,利用相关研究样本,分别从不同行业、不同地区、不同企业规模以及企业不同的研发强度四个方面对合作创新绩效进行统计与描述,以反映研究样本内企业处于不同行业、地区以及不同规模和研发强度下的合作创新绩效情况,最后进一步实证考察在不同合作创新关系下,企业的创新绩效会有何变化,本文主要从与供应商合作、与客户公司合作以及与科研院所合作三种合作关系来讨论,并分为三种情况来考察,即当企业存在一种合作关系、两种合作关系以及三种合作关系时企业创新绩效的变化,这对于企业在合作创新过程中选择合适的合作创新关系来提高企业的创新绩效具有重要作用。本文得出的结论是：代表企业合作创新程度的合作费用投入与企业创新绩效呈U型,即合作费用的投入在初始阶段对企业的创新绩效并没有起到促进作用,反而会减少,但当合作费用投入到一定阶段时,它的正向促进作用才逐渐发挥出来；当企业只有一种合作关系时,企业与客户公司合作相比其他两种合作关系更能给企业带来较高的创新绩效；当企业存在两种合作关系时,企业同时与客户公司、科研院所合作,对于提升企业整体创新绩效的效果是非常显著的,且创新绩效效果最大,而企业同时与供应商、客户公司合作时,对企业的新产品是有较好的促进作用,企业同时与供应商、科研院所合作时,对企业的新工艺是有较好的促进作用；当企业存在三种合作关系时,其对企业的创新绩效的促进作用是显著的,且均高于企业只有一种和两种合作关系时的创新绩效。