目的本文旨在分析新农合政策对参合居民的住院就诊机构选择的影响,通过对封顶线、起付线、人均定点医疗机构数和报销比例4个自变量,以及病人特征等控制变量进行二元logistic回归,筛选出影响新农合参合居民对住院机构选择的因素,并结合对新农合政策的定性分析,为研究、制定相关卫生政策,调整卫生服务体系提供政策依据。方法资料来源于江苏省2008年张家港市和睢宁县的“新农合报销数据库”,考虑到数据的完整性和代表性,以及患者在两类医疗机构就医的分布特点,运用分层随机抽样法,选择呼吸系统、消化系统和循环系统三类疾病的518例住院患者作为研究对象,建立居民就医行为模型,进行统计学评价。研究方法包括方差膨胀因子VIF法、逐步回归分析法和二元logistic回归法,分析软件采用SPSS18.0软件。结论运用二元logistic回归模型分析农村参合居民住院就医行为。影响农村参合居民对住院机构选择的显著因素有人均定点医疗机构数、卫技人员数、床位数、医疗服务价格和疾病类型。根据上述研究,建议政府应改进筹资方式,进一步加大筹资力度和补偿比例,建立合理有效的补偿机制；同时充分引入市场竞争,加强院间合作和人员管理,以合理分布卫生资源,缓解就医难题。