实施创新驱动战略需要切实发挥企业作为创新主体的作用,而现实中很多行业都是国有企业、私营企业、外资企业并存,甚至单一企业内部也存在多种所有权,即属于混合所有制结构。另一方面,创新越来越复杂,企业出于自利目的,会与其他企业或组织进行创新合作,由此形成的创新网络将进一步影响企业的创新行为。在混合所有制下,企业基于最大化自身利益的目的,会形成怎样的研发网络结构?该结构与社会最优是否一致?政府政策如何影响网络结构?本论文将混合所有制和网络形成的有关研究相结合,对上述问题进行探讨。本文在对混合所有制行业中的创新、网络形成、创新网络等研究进行综述基础上,先后分三部分从理论上研究了混合所有制下所形成的R&D网络的稳定性和有效性以及二者之间的一致性问题：首先不考虑政府作用,在一个国家的封闭环境下研究一个国企和两个私企所形成的R&D网络的结构；接着引入国外企业,探讨国有企业、私有企业和外资企业三家企业的情形；然后引入政府角色对上述研究进行扩展,分别讨论封闭环境和开放环境下,R&D补贴在网络形成中的作用以及对企业R&D行为的影响。文章最后运用联合申请专利的数据对汽车发动机行业与电子计算机及专用设备行业的R&D合作网络进行了比较分析。本文理论部分通过模型分析和计算机仿真主要得到如下一些结论：1.封闭环境中R&D网络的稳定性：无R&D补贴时,完全网络是两两稳定和强稳定的；当且仅当β<0.07时,私有企业局部网络是两两稳定和强稳定的。有R&D补贴时,完全网络是惟一两两稳定和强稳定的网络。2.封闭环境中R&D网络的有效性：无R&D补贴时,除空网络之外,完全网络、国企核心星、私企核心星、私企局部网络、国企局部网络在适当的溢出范围内,都可能是帕累托有效的,但完全网络是唯一强有效的网络。有R&D补贴时,完全网络总是帕累托有效的；当且仅当β<0.16时,私企核心星是帕累托有效网络；完全网络是惟一强有效的网络。3.开放环境中R&D网络的稳定性：无论是否有R&D补贴,完全网络是惟一两两稳定和强稳定的网络。4.开放环境中R&D网络的有效性：无R&D补贴时,完全网络、国内局部连通网络、国企核心星、国内私企核心星、国外私企核心星五种网络在适当的溢出范围内可能是帕累托有效的,而空网络、私企局部连通网络、国企外企局部连通网络不可能是帕累托有效网络；对所有溢出程度而言,完全网络是惟一强有效网络；当且仅当β<0.86时,完全网络使得国内企业局部有效和网络整体有效一致。有R&D补贴时,完全网络、国内私企核心星、国外私企核心星三种网络可能是帕累托有效的,而其他网络不可能是帕累托有效网络；对所有溢出程度而言,完全网络是惟一强有效网络,也是国内局部有效和网络整体有效一致的网络。经验分析方面,分别对辽宁和广东的汽车发动机行业R&D网络、辽宁和江苏的电子计算机及专用设备行业R&D网络进行了比较分析,得出的主要结论有：1.从整体来看,R&D网络是稀疏的,但呈现出局部密集的特点；国有企业在R&D网络中处于相对核心的地位,私有企业处于边缘位置；国有企业及其众多子公司之间形成了比较封闭的R&D体系；国有企业和私有企业之间的R&D合作还比较分散。2.从行业来看,在高技术行业中,R&D网络表现出更强的关联性,国有企业和私有企业之间的R&D合作也比在传统行业中更为常见。3.从区域来看,在经济发达地区,R&D合作更为紧密,R&D网络具有更高的聚类系数；国有企业在R&D网络中的作用在经济发达地区比在经济欠发达地区更低,大学和科研院所的作用则相反。