素有“松树癌症”之称的松材线虫病是对松科植物危害最大的一类病害,马尾松在松科植物中占比最大,受松材线虫病的危害也最严重。近年来,内生细菌在防治植物病害方面的研究逐渐增多,但有关马尾松不同部位内生细菌群落结构变化与松材线虫病之间关系的报道并不多见。因此本研究首次通过PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)技术及高通量测序技术分析了马尾松不同部位内生细菌的结构差异,发掘马尾松体内具有生防潜力的内生细菌,为后期松材线虫病的生防研究提供参考。本研究主要结论如下:(1)通过PCR-DGGE凝胶电泳技术对松针、松干与根系样本进行分析,发现根系部位的条带数量最多,且亮度明显的条带也最多;松针部位的条带数量最少,亮度明显的条带少于根系;松干部位的条带数量介于根系与松针之间,亮度明显的条带最少。表明不同部位内生细菌群的种类和数量相差较大,根系>松干>松针。(2)运用PAST软件和Quantity One软件对松干内生细菌菌群的DGGE电泳条带图进行分析,发现侵染15天时干部内生细菌菌群的种类与数量已表现明显增多的趋势,但增加的幅度不大;侵染30天内生细菌菌群的种类与数量进一步增多,变化幅度最大;侵染45天其种类与数量进一步扩大达最高水平,但变化幅度较侵染30天显著降低;至侵染60天菌群种类与数量变化保持相对稳定。松针部位在侵染15天内生细菌菌群的种类与数量变化幅度较小,但总体仍表现为增多的趋势,至侵染30天菌群种类与数量才明显增多;侵染45天后针部菌群的种类与数量最多,变化幅度也达最大;侵染60天菌群数量与种类有部分减少,但变化幅度相对稳定;相比松干与松针部位,根系部位内生细菌菌群的种类与数量不随侵染时间延长表现明显变化。可知,不同部位内生细菌菌群的结构变化差异显著,松干>松针>根系。(3)基于高通量测序技术对马尾松内生细菌进行检测与分析,共检测到内生细菌442属,分布于35门、49纲、110目、210科。通过菌群多样性分析,发现相同菌属在不同部位丰度变化趋势不同。松干部位的甲基杆菌属(Methylobacterium)、假单胞菌属(Pseudomonas)、短小杆菌属(Curtobacterium)、Hymenobacter属相对丰度随侵染时间延长表现为逐渐增加的变化趋势,在松针部位变化趋势相反;泛菌属(Pantoea)与放线孢菌属(Actinomycetospora)的丰度变化主要体现在松干部位,侵染时间增加相对丰度也逐渐增加,在松针部位并不表现明显的变化规律。(4)通过对不同侵染阶段松干部位内生细菌的结构进行对比分析可知,松干部位的Mucilaginibacter属、变形杆菌属(Gammaproteobacteria)、Occallatibacter属、酸杆菌属(Acidobacteria)与溶杆菌属(Lysobacter)在空白对照组相对丰度较弱,侵染15天后显著增加,但苗木表面并不表现任何症状。因此在松材线虫传播的高峰期实时监测马尾松的菌群变化对松材线虫病的早期鉴定可能具有一定的帮助。综上所述,松材线虫病的侵染可对马尾松不同部位内生细菌群落结构造成不同影响,且随侵染时间延长,不同部位内生细菌菌群的结构差异也逐渐增大。其中松干部位对松材线虫病的响应最迅速,针部次之,根部基本不受影响,通过对不同部位进行相对全面的菌群动态信息分析,可望发现有助于松科植物生长发育的生防菌,为松材线虫病的防治提供新的研究方向。