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Leptin是leptin基因在脂肪组织表达的一种蛋白质,已证明该基因单核苷酸多态性与奶牛的繁殖力、产奶量、体细胞计数、乳蛋白率等性状相关。本研究检测了中国荷斯坦牛leptin基因启动子区与外显子2区多态性,并进一步分析了这些多态性与产奶性能的关系,结果如下:以抽样的190头中国荷斯坦牛为研究对象,通过运用PCR-RFLP方法,对leptin基因外显子2区E2JW位点和E2FB位点进行了单核苷酸多态性检测,并获得不同基因型,然后结合DHI数据,设计混合模型,应用软件SAS 8.2分析了两个多态位点对产奶性能的影响;另外,通过运用PCR-SSCP方法对该基因启动子区进行多态性检测,发现了5种基因型(AA、AB、AC、BB、BC),测序证实此序列存在3个等位基因(A: 528C-617G-618C,B: 528C-617A-618T,C: 528T-617G-618C),并且包含UASMS2(即528 C/T)和PSD(即617G/A - 618C/T)两个多态位点,而PSD多态位点则为首次发现,并用同样的数据统计方法分析了此序列多态性对产奶性能的影响。结果发现:在leptin基因外显子2区,E2JW多态位点对乳脂率(P=0.02)、305天产奶量(P=0.03)的影响显著,E2FB多态位点对乳蛋白率的影响显著(P=0.04)。在分析E2JW和E2FB两多态位点交互效应时,对于305天产奶量来讲,MM*PQ和MM*QQ基因型牛个体与MN*PP基因型牛个体差异显著;NN*PQ基因型牛个体分别与MM*PP、MM*QQ和MN*QQ基因型牛个体差异显著;但此交互效应对牛乳蛋白率、乳脂率、体细胞计数影响均不显著。在leptin基因启动子区,本研究序列多态性与305天产奶量显著相关;对于乳脂率来讲,AB基因型牛个体(P=0.03)和BB基因型牛个体(P=0.04)均与BC基因型牛个体之间均存在显著性差异;但此序列多态性对乳蛋白率和SCC的影响不显著(P>0.05)。因此,leptin基因外显子2区E2FB多态位点可以作为中国荷斯坦牛305天产奶量和乳脂率的一个遗传分子标记,E2JW多态位点可以作为影响奶牛乳蛋白率的一个遗传分子标记,而E2FB和E2JW两个多态位点交互作用共同影响305天产奶量(P=0.045);启动子区UASMS2和PSD多态位点可作为影响乳脂率和305天产奶量的遗传分子标记。