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线粒体16SrRNA、CO Ⅰ、COⅡ基因是物种线粒体基因研究中比较普遍的基因序列,在群体遗传结构,种系发生及亲缘关系研究等方面应用广泛,是比较忠实的遗传分子标记。本文选取中国的皱纹盘鲍(H.discus hannai),澳大利亚的黑唇鲍(H.rubra)和新西兰的黑足鲍(H.iris)3种典型经济鲍作为研究对象,通过测定其线粒体16SrRNA、COⅠ、COⅡ基因序列片段,来分析其单核苷酸多态性及种内种间一致性和系统发育关系,为鲍的新品种引进、杂交育苗提供理论支持。本研究主要获得以下结果:(1)三种鲍线粒体16S rRNA基因片段测序及系统发育分析采用基因测序方法,对皱纹盘鲍(H.hannai)、黑足鲍(H.iris)和黑唇鲍(H.rubra)线粒体16S rRNA基因序列片段进行PCR扩增和测序。试验得到的序列长度分别为皱纹盘鲍544bp,黑唇鲍550bp,黑足鲍546bp;A+T碱基含量比例分别为皱纹盘鲍58.1%,黑唇鲍56.2%,黑足鲍56.4%;种内一致性分别为皱纹盘鲍96.37%,黑唇鲍97.51%,黑足鲍99.06%。三种鲍的种间一致性为93.94%。皱纹盘鲍的碱基突变率为0.37%,黑足鲍的碱基突变率为0.55%,黑唇鲍的碱基突变率为0.36%。黑足鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.148,皱纹盘鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.116,皱纹盘鲍与黑足鲍间的遗传距离为0.077。(2)三种鲍线粒体CO Ⅰ基因片段测序及系统发育研究分析采用基因测序方法,对皱纹盘鲍(H.hannai)黑足鲍(H.iris)和黑唇鲍(H.rubra)线粒体COⅠ基因序列片段进行PCR扩增和测序。实验得到的序列长度分别为皱纹盘鲍554bp,黑唇鲍573bp,黑足鲍552bp;A+T碱基含量比例分别为皱纹盘鲍55.4%,黑唇鲍52.3%,黑足鲍53.5%;种内一致性分别为皱纹盘鲍97.66%,黑唇鲍98.49%,黑足鲍97.42%。三种鲍的种间一致性为89.12%。皱纹盘鲍的碱基突变率为0.36%,黑足鲍的碱基突变率为0.36%,黑唇鲍的碱基突变率为2.09%。黑足鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.204,皱纹盘鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.200,皱纹盘鲍与黑足鲍间的遗传距离为0.186。(3)种鲍线粒体COⅡ基因片段测序及系统发育研究分析采用基因测序方法,对皱纹盘鲍(H.hannai)、黑足鲍(H.iris)和黑唇鲍(H.rubra)线粒体COⅡ基因序列片段进行PCR扩增和测序。实验得到的序列长度分别为皱纹盘鲍151bp,黑唇鲍150bp,黑足鲍153bp;A+T碱基含量比例分别为皱纹盘鲍58.3%,黑唇鲍53.7%,黑足鲍56.5%;种内一致性分别为皱纹盘鲍98.23%,黑唇鲍99.33%,黑足鲍91.83%。三种鲍的种间一致性为92.51%。皱纹盘鲍的碱基突变率为3.31%,黑足鲍的碱基突变率为19.61%,黑唇鲍的碱基突变率为2.00%。黑足鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.124,皱纹盘鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.192,皱纹盘鲍与黑足鲍间的遗传距离为0.071。以上结果表明:线粒体16SrRNA、COⅠ、COⅡ基因序列片段适用于鲍种间遗传分析、系统发生及亲缘关系研究。数据表明线粒体16SrRNA序列最为保守,COⅡ基因序列碱基突变率最高。皱纹盘鲍与黑足鲍间的亲缘关系最近。属于同一地理种群的鲍亲缘关系较近。