无脊椎动物休眠卵能够在沉积物中存活数十年,甚至更长的时间。它们不仅构成了生态的和进化的储存库,还影响着种群、群落、甚至整个生态系统在应对环境变化时的响应速度和方向。休眠卵库的研究集中于温带地区,本文以南海海岸带水域(近岸浅海海域、典型海湾大亚湾和陆地淡水水域)为代表探究了热带和亚热带水域无脊椎动物休眠卵的物种组成和群落结构,借助单卵DNA条形码技术来解决休眠卵鉴定费时费力且成功率低的问题。本文分别在地理大尺度和地理小尺度上开展研究,一方面对热带和亚热带水域的休眠卵库动力学进行研究;另一方面在不同空间尺度下和不同生境类型下探究休眠卵群落结构空间分布格局,并进一步探究形成不同分布格局的驱动因素。以南海近岸浅海海域为代表,在地理大尺度上探究纬度变化对无脊椎动物休眠卵群落结构的影响。基于单卵DNA条形码技术共获得物种79种,其中轮虫类8种、桡足类19种、枝角类12种和其它类40种。南海近岸浅海海域休眠卵的丰度为0.15到5.88 ind g-1,物种丰富度为6到30种。丰度和丰富度均与纬度变化无明显的相关性,水温和Chla则是驱动休眠卵群落差异的主要因素。同一城市的近岸浅海样点群落结构较为相似,不同城市间的近岸浅海样点群落结构差异较大。以典型海湾大亚湾为代表,在地理小尺度上调查了人类活动扰动对无脊椎动物休眠卵群落结构的影响。基于单卵DNA条形码技术共获得物种25种,其中轮虫类8种、桡足类7种、枝角类5种和其它类5种。典型海湾大亚湾的休眠卵的丰度为0.27到4.18 ind g-1,水平分布总趋势呈现湾外向湾内递减,优势种的水平分布也呈相同趋势。垂直分布呈现先增加后急剧下降的趋势,最高丰度出现在4-5cm。在深度为60cm处发现休眠卵,基于沉积速率得到休眠卵的最大存活年龄为92.3年。在深度为40cm处发现了可存活的休眠卵,基于沉积速率得知其年龄为64.6年。基于卵丰度与沉积物年龄的回归得到年平均存活率为为94.56%。以南海近岸陆地淡水水域为代表,同时在地理大尺度和地理小尺度上调查池塘和河流两种生境群落结构间的差异以及驱动差异产生的环境因素。基于单卵DNA条形码技术共获得物种217种,其中轮虫类64种、桡足类10种、枝角类50种和其它类93种。轮虫类物种在丰度和丰富度上均占有绝对的优势。池塘和河流两种生境无脊椎动物休眠卵的丰度分别为0.02到8.70 ind g-1和0.07到3.90ind g-1,池塘的丰度远高于河流。在地理大尺度上分析,纬度变化与休眠卵的平均丰度无明显的相关性。在地理小尺度上分析,两种生境休眠卵的群落结构存在差异且受不同环境因子的驱动,盐度和降雨量对池塘中休眠卵群落结构的影响较大,沉积物的p H对休眠卵的群落结构影响较大,而气温对两种生境的休眠卵群落结构均产生较大的影响。本文为热带和亚热带水域存在无脊椎动物休眠卵库提供了基础数据,并揭示了纬度变化、人类活动以及环境因子对群落结构的影响,其中人类活动可能对休眠卵库、水中活跃个体,甚至整个水生生态系统都产生潜在的干扰。在不同的空间尺度上驱动休眠卵群落结构变化的因素有所不同,在不同生境中休眠卵的群落结构也存在较大的差异。休眠卵库不仅可以作为生物多样性减少的预防机制,还可以作为环境变化的响应器,通过休眠卵的群落结构与环境因素的关系来预测环境变化。值得一提的是,单卵DNA条形码技术的建立大大地提高了研究的准确度和效率,克服了以形态学为基础进行鉴定的孵化法的局限、费时和费力等问题。休眠卵库的结构和特征对群落的结构和动态有着潜在的和重要的影响,本文对南海海岸带无脊椎动物休眠卵库的研究不仅补充了休眠卵研究的不足,还为水生系统生态学研究提供有价值的信息和新的研究思路。