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苦瓜枯萎病是由尖孢镰刀菌苦瓜专化型(Fusarium oxysporum Schl. f. sp. momordicae Sun & Huang)侵染引起的一种植物土传病害,遍及中国、菲律宾、日本以及印度等亚洲国家的苦瓜主产区,严重制约了当地苦瓜产业发展。本研究对尖孢镰刀菌苦瓜专化型病原菌的鉴定、分子检测、遗传多样性、种质资源抗性的苗期鉴定以及病原菌与寄主互作的差异蛋白质分析等方面进行研究,获主要结果如下：1、2009～2010年从我国6个省份采集苦瓜枯萎病标样分离的菌株,根据病菌形态特征、致病性和rDNA-ITS序列测定的结果,将48株菌株鉴定为尖孢镰刀菌苦瓜专化型。不同菌株对苦瓜幼苗的致病力存在差异,菌株的致病力强弱与菌落产生的色素无关。测试的菌株除侵染苦瓜的幼苗外,还可以侵染蒲瓜、园扁葫芦和长颈葫芦等瓠瓜变种的幼苗,但不侵染瓠瓜变种细腰葫芦及其他瓜类的幼苗。在rDNA-ITS序列聚类树中,48株自测的苦瓜枯萎病菌株与来自GenBank数据库中的13株尖孢镰刀菌菌株聚成一群,与其他镰刀菌菌株分在不同进化枝上,但rDNA-ITS序列不能把尖孢镰刀菌苦瓜专化型菌株与种内的其他专化型菌株区分成不同类群。2.用320条随机引物对不同地理来源的24株瓜类枯萎病菌的基因组DNA进行RAPD-PCR扩增和图谱特征分析,获得大小为519bp的尖孢镰刀菌苦瓜专化型菌株特异的片段S58-519,经回收纯化和克隆测序,设计出一对特异引物F1/R1,成功将目标RAPD标记转换成SCAR标记R8-256。验证实验结果表明,该标记表现出稳定的特异性和专一性,设计的特异引物可以直接用来鉴别尖孢镰刀菌苦瓜专化型菌株,不需要进行寄主回接试验。建立了尖孢镰刀菌苦瓜专化型菌株的SCAR-PCR检测体系,该体系能检测到浓度为1 pg·μL-1的病原菌基因组DNA、土壤中100个病原孢子·g-1和已感病但未显症的苦瓜植株组织中的苦瓜枯萎病菌。3、用18条RAPD标记多态性随机引物分析48株尖孢镰刀菌瓜类专化型菌株的遗传多样性,标记出的DNA条带多态性检测率平均为97.81%,平均每个引物产生14.5条多态性条带；在尖孢镰刀菌瓜类专化型菌株的RAPD分析聚类树状图中,所有苦瓜枯萎病菌株聚在一个分支上(G1群),菌株间的遗传相似系数范围为0.92-1.00,具有较高的遗传相似性,且菌株的聚群与地理来源存在一定的相关性。用7对AFLP标记多态性丰富的EcdRI-MseI选择性扩增引物分析48株不同地理来源的尖孢镰刀菌苦瓜专化型菌株的遗传多样性,扩增位点的多态率平均为99.14%,单对引物扩增的多态位点平均为51.86个；在尖孢镰刀菌苦瓜专化型菌株的AFLP分析聚类树状图中,菌株聚群与菌株致病力存在一定相关性,其中高毒力菌株聚在AG1群,遗传相似系数为0.91-0.99,其他相对低毒力的菌株分别聚在11个分支上,遗传差异显著；高毒力菌株的聚群与菌株的地理来源高度相关；利用PopGene软件分析6个苦瓜枯萎病菌地理居群间的遗传分化程度,发现居群间的相似程度较低,遗传距离较大,菌株的遗传分化主要发生在居群间,菌株居群间的基因交换较少,表明苦瓜枯萎病菌株的遗传多样性程度高。4.用苗期浸根接种法对143份苦瓜高代自交系材料进行抗枯萎病鉴定,发现苦瓜种质资源对枯萎病菌株AS-1的抗性反应主要集中在高感和感病类型；8份抗病材料均来自中国,抗病种质资源的果实性状主要表现为短棒形、皮色浅绿、瓜瘤为条瘤和条粒瘤；东南亚国家及日本的苦瓜种质资源中没有表现抗性的材料。5.应用双向电泳技术研究苦瓜抗枯萎病材料MC1-1-1和感枯萎病材料MCl-1的根系在病菌胁迫下的蛋白质差异表达情况。与对照组比较,接菌后根系蛋白质丰度变化差异量达150%以上的蛋白点有25个,其中苦瓜感枯萎病材料MCl-1有12个差异蛋白质点表达量上调,3个表达量下调；苦瓜抗枯萎病材料MC1-1-1有4个差异蛋白质点表达量上调,6个表达量下调。用MALDI-TOF-TOF/MS串联质谱鉴定了其中22个蛋白点,将蛋白点的肽指纹图谱测定结果通过MASCOT数据库检索比对,成功鉴定出17个蛋白点,其中参与细胞防御或自由基清除的蛋白8种,参与基础代谢的蛋白4种,参与细胞信号转导的蛋白2种,参与蛋白加工的蛋白2种,参与光合作用的蛋白1种。