农业综合开发目前是吉林省乃至我国政府支持和保护农业产业化的战略性措施,对于推动农业产业化及农村的经济结构调整、提高农民收入水平、改善农村生产生活环境具有重要的作用,农业综合开发资金参股经营是农业综合开发的一项重点扶持方式。吉林省是我国的农业大省,吉林省农业综合开发资金参股经营自2005年开始,是国家财政部推广农业综合开发参股经营模式的首批试点,陆续参股7户企业共10个项目,国家及吉林省投入参股经营资金总额共20100万元。截至2015年末,参股经营企业或多或少存在不同程度的问题。本文通过对农业综合开发资金参股经营企业的发展现状、取得的经济效益及社会效益等经营效果深入探究与分析,找出参股经营存在产权不清、政企不分、投资回报率低、参股经营试点成效不显著的问题,总结参股经营的经验及不足,阐明吉林省农业综合开发资金参股经营受企业制度建设不完善、小股东知情权弱化、项目建设资金不足、参股企业不重视人才引进、质量控制及技术创新不到位的主体因素及体制上存在缺陷、试点操作不规范等发展瓶颈的客观因素,对农业综合开发资金参股经营企业监管工作提出了开展资本运作,适时退出参股经营等切实可行的合理化建议。